論文の概要: BrainSegNet: A Novel Framework for Whole-Brain MRI Parcellation Enhanced by Large Models
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2601.09263v1
- Date: Wed, 14 Jan 2026 07:58:36 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-01-15 18:59:20.323718
- Title: BrainSegNet: A Novel Framework for Whole-Brain MRI Parcellation Enhanced by Large Models
- Title(参考訳): BrainSegNet: 大規模モデルによって強化された全脳MRIパーセレーションのための新しいフレームワーク
- Authors: Yucheng Li, Xiaofan Wang, Junyi Wang, Yijie Li, Xi Zhu, Mubai Du, Dian Sheng, Wei Zhang, Fan Zhang,
- Abstract要約: MRIによる全脳のパーセレーションは、脳を多数の小さな不規則な形状の領域に分割する複雑さのため、非常に難しい課題である。
伝統的にテンプレート登録法が用いられてきたが、近年の進歩はより高速なパーセレーションのために深層学習に移行している。
本稿では,SAMを正確に95領域に適応させる新しいフレームワークであるBrainSegNetを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 12.480197601820523
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Whole-brain parcellation from MRI is a critical yet challenging task due to the complexity of subdividing the brain into numerous small, irregular shaped regions. Traditionally, template-registration methods were used, but recent advances have shifted to deep learning for faster workflows. While large models like the Segment Anything Model (SAM) offer transferable feature representations, they are not tailored for the high precision required in brain parcellation. To address this, we propose BrainSegNet, a novel framework that adapts SAM for accurate whole-brain parcellation into 95 regions. We enhance SAM by integrating U-Net skip connections and specialized modules into its encoder and decoder, enabling fine-grained anatomical precision. Key components include a hybrid encoder combining U-Net skip connections with SAM's transformer blocks, a multi-scale attention decoder with pyramid pooling for varying-sized structures, and a boundary refinement module to sharpen edges. Experimental results on the Human Connectome Project (HCP) dataset demonstrate that BrainSegNet outperforms several state-of-the-art methods, achieving higher accuracy and robustness in complex, multi-label parcellation.
- Abstract(参考訳): MRIによる全脳のパーセレーションは、脳を多数の小さな不規則な形状の領域に分割する複雑さのため、非常に難しい課題である。
従来、テンプレート登録方式が用いられてきたが、最近の進歩はより高速なワークフローのためにディープラーニングに移行している。
Segment Anything Model (SAM)のような大きなモデルは、伝達可能な特徴表現を提供するが、脳のパーセレーションに必要な高精度に調整されていない。
そこで本研究では,SAMを正確に95領域に適応させる新しいフレームワークであるBrainSegNetを提案する。
我々は、U-Netスキップ接続と特殊なモジュールをエンコーダとデコーダに統合することによりSAMを強化し、微細な解剖学的精度を実現する。
鍵となるコンポーネントは、U-Netスキップ接続とSAMのトランスフォーマーブロックを組み合わせたハイブリッドエンコーダ、様々なサイズの構造物のためのピラミッドプーリングを備えたマルチスケールアテンションデコーダ、エッジを鋭くするための境界リファインメントモジュールである。
Human Connectome Project (HCP)データセットの実験結果によると、BrainSegNetはいくつかの最先端の手法より優れており、複雑で複数ラベルのパーセレーションにおいて高い精度と堅牢性を実現している。
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