論文の概要: PyHealth 2.0: A Comprehensive Open-Source Toolkit for Accessible and Reproducible Clinical Deep Learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2601.16414v1
- Date: Fri, 23 Jan 2026 03:00:23 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-01-26 14:27:27.519209
- Title: PyHealth 2.0: A Comprehensive Open-Source Toolkit for Accessible and Reproducible Clinical Deep Learning
- Title(参考訳): PyHealth 2.0: アクセシブルで再現可能な臨床深層学習のための総合的オープンソースツールキット
- Authors: John Wu, Yongda Fan, Zhenbang Wu, Paul Landes, Eric Schrock, Sayeed Sajjad Razin, Arjun Chatterjee, Naveen Baskaran, Joshua Steier, Andrea Fitzpatrick, Bilal Arif, Rian Atri, Jathurshan Pradeepkumar, Siddhartha Laghuvarapu, Junyi Gao, Adam R. Cross, Jimeng Sun,
- Abstract要約: PyHealth 2.0は、わずか7行のコードで予測モデリングを可能にする、拡張された臨床ディープラーニングツールキットである。
オープンソースファウンデーションであり、コミュニティがアクセス可能で再現可能な医療AIを推進している。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 13.56149447961567
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Difficulty replicating baselines, high computational costs, and required domain expertise create persistent barriers to clinical AI research. To address these challenges, we introduce PyHealth 2.0, an enhanced clinical deep learning toolkit that enables predictive modeling in as few as 7 lines of code. PyHealth 2.0 offers three key contributions: (1) a comprehensive toolkit addressing reproducibility and compatibility challenges by unifying 15+ datasets, 20+ clinical tasks, 25+ models, 5+ interpretability methods, and uncertainty quantification including conformal prediction within a single framework that supports diverse clinical data modalities - signals, imaging, and electronic health records - with translation of 5+ medical coding standards; (2) accessibility-focused design accommodating multimodal data and diverse computational resources with up to 39x faster processing and 20x lower memory usage, enabling work from 16GB laptops to production systems; and (3) an active open-source community of 400+ members lowering domain expertise barriers through extensive documentation, reproducible research contributions, and collaborations with academic health systems and industry partners, including multi-language support via RHealth. PyHealth 2.0 establishes an open-source foundation and community advancing accessible, reproducible healthcare AI. Available at pip install pyhealth.
- Abstract(参考訳): ベースラインの複製が難しいこと、高い計算コスト、必要なドメインの専門知識は、臨床AI研究に永続的な障壁を生み出します。
PyHealth 2.0は、7行のコードで予測モデリングを可能にする拡張された臨床深層学習ツールキットである。
PyHealth 2.0は、(1)15以上のデータセット、20以上の臨床タスク、25以上のモデル、および5以上の解釈可能性メソッド、および、様々な臨床データモダリティをサポートする単一のフレームワーク内の適合予測を含む不確実性定量化を含む、再現性と互換性に対処する包括的ツールキット、(2)多要素データと最大39倍の高速処理と20倍のメモリ使用量を備えた、アクセシビリティを重視した設計、(2)16GBのラップトップからプロダクションシステムへの作業を可能にする、400以上のメンバによるアクティブなオープンソースコミュニティ。
PyHealth 2.0はオープンソースファウンデーションとコミュニティを確立し、アクセス可能で再現可能なヘルスケアAIを推進している。
pip install pyhealth.
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