論文の概要: Coarse-Grained Boltzmann Generators
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2602.10637v1
- Date: Wed, 11 Feb 2026 08:37:13 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-02-12 21:44:01.597882
- Title: Coarse-Grained Boltzmann Generators
- Title(参考訳): 粗粒ボルツマン発電機
- Authors: Weilong Chen, Bojun Zhao, Jan Eckwert, Julija Zavadlav,
- Abstract要約: 本稿では,拡張性のある低次モデリングを重要度サンプリングの精度で統一するフレームワークを提案する。
CG-BGは粗い座標空間で作用し、平均力の学習電位を用いてフローベースモデルによって生成されたサンプルを再重み付けする。
以上の結果から,CG-BGは高度に還元された表現の中で,明示的な溶媒によって媒介される複雑な相互作用を忠実に捉えていることが明らかとなった。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.8880597165704
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Sampling equilibrium molecular configurations from the Boltzmann distribution is a longstanding challenge. Boltzmann Generators (BGs) address this by combining exact-likelihood generative models with importance sampling, but their practical scalability is limited. Meanwhile, coarse-grained surrogates enable the modeling of larger systems by reducing effective dimensionality, yet often lack the reweighting process required to ensure asymptotically correct statistics. In this work, we propose Coarse-Grained Boltzmann Generators (CG-BGs), a principled framework that unifies scalable reduced-order modeling with the exactness of importance sampling. CG-BGs act in a coarse-grained coordinate space, using a learned potential of mean force (PMF) to reweight samples generated by a flow-based model. Crucially, we show that this PMF can be efficiently learned from rapidly converged data via force matching. Our results demonstrate that CG-BGs faithfully capture complex interactions mediated by explicit solvent within highly reduced representations, establishing a scalable pathway for the unbiased sampling of larger molecular systems.
- Abstract(参考訳): ボルツマン分布から平衡分子配置をサンプリングすることは長年の課題である。
ボルツマン・ジェネレータ(BG)は、正確な類似生成モデルと重要なサンプリングを組み合わせることでこの問題に対処するが、実用的スケーラビリティは限られている。
一方、粗粒のサロゲートは、有効次元を減らし、より大きなシステムのモデリングを可能にするが、漸近的に正しい統計を保証するのに必要な重み付けプロセスは欠如していることが多い。
本研究では,大規模縮小次数モデリングを重要サンプリングの精度で統一する原理的フレームワークであるCarse-Grained Boltzmann Generators (CG-BGs)を提案する。
CG-BGは粗い座標空間で作用し、平均力(PMF)の学習電位を用いてフローベースモデルによって生成されたサンプルを再重み付けする。
重要なことは、このPMFは力のマッチングによって高速に収束したデータから効率的に学習できることである。
以上の結果から,CG-BGは高度に還元された表現の中で,明示的な溶媒によって媒介される複雑な相互作用を忠実に捉え,大規模分子系の非偏平サンプリングのためのスケーラブルな経路を確立した。
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