論文の概要: Enhanced Protein Intrinsic Disorder Prediction Through Dual-View Multiscale Features and Multi-objective Evolutionary Algorithm
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2603.06292v1
- Date: Fri, 06 Mar 2026 13:51:08 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-03-09 13:17:45.811605
- Title: Enhanced Protein Intrinsic Disorder Prediction Through Dual-View Multiscale Features and Multi-objective Evolutionary Algorithm
- Title(参考訳): Dual-View Multiscale FeaturesとMulti-Objective Evolutionary Algorithmによるタンパク質内因性障害の予測
- Authors: Shaokuan Wang, Pengshan Cui, Yining Qian, An-Yang Lu, Xianpeng Wang,
- Abstract要約: 内在的に乱れたタンパク質の領域は、細胞シグナル伝達と薬物発見において重要な役割を担っている。
既存の方法は、しばしばシングルビュー表現や厳密な手動融合戦略に依存している。
本稿では,D2MOE,デュアルビューマルチスケール特徴量と多目的進化アルゴリズムを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.5218851233971797
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Intrinsically disordered regions of proteins play a crucial role in cell signaling and drug discovery. However, their high structural flexibility makes accurate residue-level prediction challenging. Existing methods often rely on single-view representations or rigid manual fusion strategies, which fail to effectively balance the complex interplay between local amino acid preferences and long-range sequence patterns. To address these limitations, we propose D2MOE, a Dual-View Multiscale Features and Multi-objective Evolutionary Algorithm, which consists of two stages. First, a dual-view multiscale feature extraction method is introduced. This method integrates evolutionary views with deep semantic views and employs multiscale extractors to capture structural information across diverse receptive fields. Second, a multi-objective evolutionary algorithm is designed to adaptively discover optimal fusion architectures. By co-evolving discrete feature selection and continuous fusion weights, the algorithm adaptively explores optimal cross-feature architectures to enhance predictive accuracy while maintaining model compactness. Experimental results across three benchmark datasets demonstrate that D2MOE consistently outperforms state-of-the-art methods. D2MOE combines the feature extraction capabilities of deep learning with the global search advantages of evolutionary algorithms, enabling efficient feature integration without manual design, and providing a robust computational tool for protein disorder prediction.
- Abstract(参考訳): 内在的に乱れたタンパク質の領域は、細胞シグナル伝達と薬物発見において重要な役割を担っている。
しかし、その高い構造的柔軟性は、正確な残差レベルの予測を困難にしている。
既存の方法は、しばしば単一ビュー表現や硬直的な手動融合戦略に依存しており、これは局所的なアミノ酸の嗜好と長距離配列パターンの間の複雑な相互作用を効果的にバランスさせるのに失敗する。
これらの制約に対処するため、D2MOE(Dual-View Multiscale Features and Multi-jective Evolutionary Algorithm)を提案する。
まず,デュアルビューのマルチスケール特徴抽出手法を提案する。
本手法は,進化的視点を深い意味的視点と統合し,多様な受容領域にまたがる構造情報の収集にマルチスケール抽出器を用いる。
第二に、最適な融合アーキテクチャを適応的に発見するために、多目的進化アルゴリズムが設計されている。
離散的な特徴選択と連続的な融合重みを共進化させることで、モデルコンパクト性を維持しながら予測精度を高めるために最適なクロスフィーチャーアーキテクチャを適応的に探索する。
3つのベンチマークデータセットの実験的結果は、D2MOEが一貫して最先端の手法より優れていることを示している。
D2MOEは、ディープラーニングの特徴抽出機能と進化アルゴリズムのグローバル検索の利点を組み合わせることで、手動設計なしで効率的な機能統合を可能にし、タンパク質障害予測のための堅牢な計算ツールを提供する。
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