論文の概要: Tabular LLMs for Interpretable Few-Shot Alzheimer's Disease Prediction with Multimodal Biomedical Data

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2603.17191v1
• Date: Tue, 17 Mar 2026 22:43:50 GMT
• ステータス: 翻訳完了
• システム内更新日: 2026-03-19 18:32:57.428034
• Title: Tabular LLMs for Interpretable Few-Shot Alzheimer's Disease Prediction with Multimodal Biomedical Data
• Title（参考訳）: 多変量バイオメディカルデータを用いたFew-Shot Alzheimer病予測のためのタブラルLSM
• Authors: Sophie Kearney, Shu Yang, Zixuan Wen, Weimin Lyu, Bojian Hou, Duy Duong-Tran, Tianlong Chen, Jason H. Moore, Marylyn D. Ritchie, Chao Chen, Li Shen,
• Abstract要約: TAP-GPT Tabular Alzheimer's Prediction GPTを提案する。 QT-PADバイオマーカーや領域レベルの構造MRI,アミロイドPET,タウPETなど,ADNI由来の4つのデータセットを対象としたTAP-GPTの評価を行った。 そこで本研究では,TAP-GPTはシミュレーションおよび実世界の欠如下で安定な性能を維持していることを示す。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 43.4291712919395
• License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
• Abstract: Accurate diagnosis of Alzheimer's disease (AD) requires handling tabular biomarker data, yet such data are often small and incomplete, where deep learning models frequently fail to outperform classical methods. Pretrained large language models (LLMs) offer few-shot generalization, structured reasoning, and interpretable outputs, providing a powerful paradigm shift for clinical prediction. We propose TAP-GPT Tabular Alzheimer's Prediction GPT, a domain-adapted tabular LLM framework built on TableGPT2 and fine-tuned for few-shot AD classification using tabular prompts rather than plain texts. We evaluate TAP-GPT across four ADNI-derived datasets, including QT-PAD biomarkers and region-level structural MRI, amyloid PET, and tau PET for binary AD classification. Across multimodal and unimodal settings, TAP-GPT improves upon its backbone models and outperforms traditional machine learning baselines in the few-shot setting while remaining competitive with state-of-the-art general-purpose LLMs. We show that feature selection mitigates degradation in high-dimensional inputs and that TAP-GPT maintains stable performance under simulated and real-world missingness without imputation. Additionally, TAP-GPT produces structured, modality-aware reasoning aligned with established AD biology and shows greater stability under self-reflection, supporting its use in iterative multi-agent systems. To our knowledge, this is the first systematic application of a tabular-specialized LLM to multimodal biomarker-based AD prediction, demonstrating that such pretrained models can effectively address structured clinical prediction tasks and laying the foundation for tabular LLM-driven multi-agent clinical decision-support systems. The source code is publicly available on GitHub: https://github.com/sophie-kearney/TAP-GPT.
• Abstract（参考訳）: アルツハイマー病(AD)の正確な診断には、表層バイオマーカーのデータを扱う必要があるが、そのようなデータは小さく不完全な場合が多く、ディープラーニングモデルは古典的な手法を上回りません。 事前訓練された大言語モデル(LLM)は、少数ショットの一般化、構造化推論、解釈可能な出力を提供し、臨床予測のための強力なパラダイムシフトを提供する。 TAP-GPT Tabular Alzheimer's Prediction GPTは、TableGPT2上に構築されたドメイン適応型表型LCMフレームワークであり、プレーンテキストではなく、表型プロンプトを用いたAD分類のための微調整である。 QT-PADバイオマーカーや領域レベルの構造MRI,アミロイドPET,タウPETなど,ADNI由来の4つのデータセットを対象としたTAP-GPTの評価を行った。 TAP-GPTは、マルチモーダルおよびアンモダル設定全体にわたって、バックボーンモデルを改善し、数ショット設定で従来の機械学習ベースラインを上回っながら、最先端の汎用LLMと競合する。 特徴選択は高次元入力における劣化を軽減し,TAP-GPTはシミュレーションおよび実世界の欠如下で安定した性能を維持していることを示す。 さらに、TAP-GPTは、確立されたAD生物学と整合した構造化されたモダリティを意識した推論を生成し、自己反射下でより大きな安定性を示し、反復的マルチエージェントシステムでの使用をサポートする。 我々の知る限り、これはマルチモーダルバイオマーカーに基づくAD予測に対する表在化LDMの初めての体系的応用であり、そのような事前訓練されたモデルは、構造化された臨床予測タスクに効果的に対処でき、表在化LDM駆動型臨床意思決定支援システムの基礎を築けることを実証している。 ソースコードはGitHubで公開されている。 https://github.com/sophie-kearney/TAP-GPT。

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