論文の概要: Multi-RF Fusion with Multi-GNN Blending for Molecular Property Prediction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2603.20724v1
- Date: Sat, 21 Mar 2026 09:18:37 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-03-24 19:11:39.057924
- Title: Multi-RF Fusion with Multi-GNN Blending for Molecular Property Prediction
- Title(参考訳): 分子特性予測のためのマルチGNNブレンドによるマルチRF核融合
- Authors: Zacharie Bugaud,
- Abstract要約: Multi-RF Fusion は ogbg-molhiv (10 種) 上で 0.8476 +/- 0.0002 の ROC-AUC テストを達成する
方法は、最大分子指紋で訓練された12のランダムフォレストモデルの平均的なアンサンブルである。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Multi-RF Fusion achieves a test ROC-AUC of 0.8476 +/- 0.0002 on ogbg-molhiv (10 seeds), placing #1 on the OGB leaderboard ahead of HyperFusion (0.8475 +/- 0.0003). The core of the method is a rank-averaged ensemble of 12 Random Forest models trained on concatenated molecular fingerprints (FCFP, ECFP, MACCS, atom pairs -- 4,263 dimensions total), blended with deep-ensembled GNN predictions at 12% weight. Two findings drive the result: (1) setting max_features to 0.20 instead of the default sqrt(d) gives a +0.008 AUC gain on this scaffold split, and (2) averaging GNN predictions across 10 seeds before blending with the RF eliminates GNN seed variance entirely, dropping the final standard deviation from 0.0008 to 0.0002. No external data or pre-training is used.
- Abstract(参考訳): Multi-RF Fusion は ogbg-molhiv (10 種) 上で 0.8476 +/- 0.0002 の ROC-AUC をテストし、HyperFusion (0.8475 +/- 0.0003) より前の OGB リーダーボードに #1 を配置する。
この手法の核となるのは、結合分子指紋(FCFP, ECFP, MACCS, 原子対 -- 4,263 次元 -- で訓練された12のランダムフォレストモデルの平均アンサンブルであり、重量は12%である。
1) デフォルトの sqrt(d) の代わりに max_features を 0.20 に設定すると、このスキャフォールド分割に対して +0.008 AUC ゲインが得られ、(2) RF とブレンドする前に GNN 予測を 10 種にわたって平均化すると、GNN の種子分散は完全に排除され、最終的な標準偏差は 0.0008 から 0.0002 に減少する。
外部データや事前トレーニングは使用しない。
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