論文の概要: GRMLR: Knowledge-Enhanced Small-Data Learning for Deep-Sea Cold Seep Stage Inference
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2603.23961v1
- Date: Wed, 25 Mar 2026 05:46:59 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-03-26 21:06:11.149096
- Title: GRMLR: Knowledge-Enhanced Small-Data Learning for Deep-Sea Cold Seep Stage Inference
- Title(参考訳): GRMLR:深海寒冷期推論のための知識強化型小型データ学習
- Authors: Chenxu Zhou, Zelin Liu, Rui Cai, Houlin Gong, Yikang Yu, Jia Zeng, Yanru Pei, Liang Zhang, Weishu Zhao, Xiaofeng Gao,
- Abstract要約: 本稿では,生態知識グラフを構造的先行として組み込んだ知識強化型分類フレームワークを提案する。
このフレームワークはマクロ-微生物結合と微生物共起パターンを融合することにより、確立した生態論理をアンダーラインテキストbfGraph-underlinetextbfRegularized underlinetextbfMultinomial underlinetextbfLogistic underlinetextbfRegression (GRMLR)モデルに内部化する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 17.364863354774425
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Deep-sea cold seep stage assessment has traditionally relied on costly, high-risk manned submersible operations and visual surveys of macrofauna. Although microbial communities provide a promising and more cost-effective alternative, reliable inference remains challenging because the available deep-sea dataset is extremely small ($n = 13$) relative to the microbial feature dimension ($p = 26$), making purely data-driven models highly prone to overfitting. To address this, we propose a knowledge-enhanced classification framework that incorporates an ecological knowledge graph as a structural prior. By fusing macro-microbe coupling and microbial co-occurrence patterns, the framework internalizes established ecological logic into a \underline{\textbf{G}}raph-\underline{\textbf{R}}egularized \underline{\textbf{M}}ultinomial \underline{\textbf{L}}ogistic \underline{\textbf{R}}egression (GRMLR) model, effectively constraining the feature space through a manifold penalty to ensure biologically consistent classification. Importantly, the framework removes the need for macrofauna observations at inference time: macro-microbe associations are used only to guide training, whereas prediction relies solely on microbial abundance profiles. Experimental results demonstrate that our approach significantly outperforms standard baselines, highlighting its potential as a robust and scalable framework for deep-sea ecological assessment.
- Abstract(参考訳): 深海寒冷期のステージアセスメントは、伝統的に高価で高リスクの有人潜水作業とマクロファージの視覚的調査に依存してきた。
微生物コミュニティは有望で費用効果の高い代替手段を提供するが、利用可能な深海データセットは、微生物の特徴次元(p = 26$)と比較して非常に小さい(n = 13$)ため、信頼性の高い推論は依然として難しい。
これを解決するために,生態知識グラフを構造的先行として組み込んだ知識強化型分類フレームワークを提案する。
マクロ-微生物結合と微生物共起パターンを融合させることにより、確立された生態学的論理を \underline{\textbf{G}}raph-\underline{\textbf{R}}egularized \underline{\textbf{M}}ultinomial \underline{\textbf{L}}ogistic \underline{\textbf{R}}egression (GRMLR) モデルに内在させ、生物学的に一貫した分類を保証するために、機能空間を効果的に制約する。
マクロ微生物の関連性はトレーニングのガイドにのみ使用されるが、予測は微生物の豊富なプロファイルにのみ依存する。
実験の結果,本手法は標準ベースラインを著しく上回り,深海環境評価のための堅牢でスケーラブルなフレームワークとしての可能性を強調した。
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