論文の概要: MOOZY: A Patient-First Foundation Model for Computational Pathology
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2603.27048v2
- Date: Tue, 31 Mar 2026 19:19:38 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-04-02 16:44:31.599766
- Title: MOOZY: A Patient-First Foundation Model for Computational Pathology
- Title(参考訳): MOOZY:計算病理のための患者第一基盤モデル
- Authors: Yousef Kotp, Vincent Quoc-Huy Trinh, Christopher Pal, Mahdi S. Hosseini,
- Abstract要約: コンピュータ病理学には、様々な臨床課題にまたがる全体スライド画像(WSI)基盤モデルが必要である。
患者中心の病態基盤モデルであるMOOZYについて述べる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 17.47449462562058
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Computational pathology needs whole-slide image (WSI) foundation models that transfer across diverse clinical tasks, yet current approaches remain largely slide-centric, often depend on private data and expensive paired-report supervision, and do not explicitly model relationships among multiple slides from the same patient. We present MOOZY, a patient-first pathology foundation model in which the patient case, not the individual slide, is the core unit of representation. MOOZY explicitly models dependencies across all slides from the same patient via a case transformer during pretraining, combining multi-stage open self-supervision with scaled low-cost task supervision. In Stage 1, we pretrain a vision-only slide encoder on 77,134 public slide feature grids using masked self-distillation. In Stage 2, we align these representations with clinical semantics using a case transformer and multi-task supervision over 333 tasks from 56 public datasets, including 205 classification and 128 survival tasks across four endpoints. Across eight held-out tasks with five-fold frozen-feature probe evaluation, MOOZY achieves best or tied-best performance on most metrics and improves macro averages over TITAN by +7.37%, +5.50%, and +7.83% and over PRISM by +8.83%, +10.70%, and +9.78% for weighted F1, weighted ROC-AUC, and balanced accuracy, respectively. MOOZY is also parameter efficient with 85.77M parameters, 14x smaller than GigaPath. These results demonstrate that open, reproducible patient-level pretraining yields transferable embeddings, providing a practical path toward scalable patient-first histopathology foundation models.
- Abstract(参考訳): コンピュータ病理学は、様々な臨床課題にまたがる全体スライド画像(WSI)基盤モデルを必要とするが、現在のアプローチは、主にスライド中心であり、多くの場合、プライベートデータと高価なペアレポートの監視に依存し、同一患者の複数のスライド間の関係を明示的にモデル化しない。
患者中心の病態基盤モデルであるMOOZYについて述べる。
MOOZYは、事前トレーニング中にケーストランスフォーマーを介して、同一患者のすべてのスライドの依存関係を明示的にモデル化し、マルチステージのオープンセルフスーパービジョンとスケールされた低コストタスク監視を組み合わせた。
ステージ1では、マスク付き自己蒸留を用いて77,134個の公開スライド特徴グリッド上に、視覚のみのスライドエンコーダを事前訓練する。
ステージ2では、これらの表現を、ケーストランスフォーマーとマルチタスクによる臨床意味論と整合させ、56の公開データセットから333のタスク(205の分類と4つのエンドポイントにまたがる128の生存タスクを含む。
MOOZYは5倍の凍結型プローブ評価を持つ8つのホールドアウトタスクにおいて、ほとんどの測定値においてベストまたはタイトベストのパフォーマンスを達成し、TITANのマクロ平均を+7.37%、+5.50%、+7.83%、PRISMの+8.83%、+10.70%、+9.78%、重み付きF1、重み付きROC-AUC、バランス付き精度で改善している。
MOOZYはパラメータ効率も85.77Mで、GigaPathの14倍小さい。
これらの結果から, 開放的, 再現可能な患者レベルのプレトレーニングにより, 移植可能な埋め込みが得られ, 拡張性患者優先の病理組織学基礎モデルへの実践的な道筋が得られた。
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