論文の概要: Automated Detection of Multiple Sclerosis Lesions on 7-tesla MRI Using U-net and Transformer-based Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2604.00469v1
- Date: Wed, 01 Apr 2026 04:30:40 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-04-02 16:44:31.832394
- Title: Automated Detection of Multiple Sclerosis Lesions on 7-tesla MRI Using U-net and Transformer-based Segmentation
- Title(参考訳): U-netとTransformer-based Segmentationを用いた7-tesla MRIにおける多発性硬化病変の自動検出
- Authors: Michael Maynord, Minghui Liu, Cornelia Fermüller, Seongjin Choi, Yuxin Zeng, Shishir Dahal, Daniel M. Harrison,
- Abstract要約: 7T FLAIRスキャンと参照WMLマスクをLesion Tool (LST)出力から解析し,その後,専門家の手による改訂を行った。
複数の解像度 (0.5x0.5x0.53, 1.0x1.0x1.03, 1.5x1.5x2.03) で7T FLAIR上での3D UNETRおよびSegFormerトランスフォーマーモデルを訓練し,BraTS 2023フレームワークのボクセルワイドおよび病変ワイドメトリクスを用いて全手法の評価を行った。
我々の最良のトランスモデル(SegFormer)は、ボクセルワイドディス0.61、病変ワイドディス0.20を達成し、改善した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 14.67453790346015
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Ultra-high field 7-tesla (7T) MRI improves visualization of multiple sclerosis (MS) white matter lesions (WML) but differs sufficiently in contrast and artifacts from 1.5-3T imaging - suggesting that widely used automated segmentation tools may not translate directly. We analyzed 7T FLAIR scans and generated reference WML masks from Lesion Segmentation Tool (LST) outputs followed by expert manual revision. As external comparators, we applied LST-LPA and the more recent LST-AI ensemble, both originally developed on lower-field data. We then trained 3D UNETR and SegFormer transformer-based models on 7T FLAIR at multiple resolutions (0.5x0.5x0.5^3, 1.0x1.0x1.0^3, and 1.5x1.5x2.0^3) and evaluated all methods using voxel-wise and lesion-wise metrics from the BraTS 2023 framework. On the held-out test set at native 0.5x0.5x0.5^3 resolution, 7T-trained transformers achieved competitive overlap with LST-AI while recovering additional small lesions that were missed by classical methods, at the cost of some boundary variability and occasional artifact-related false positives. On a held-out 7 T test set, our best transformer model (SegFormer) achieved a voxel-wise Dice of 0.61 and lesion-wise Dice of 0.20, improving on the classical LST-LPA tool (Dice 0.39, lesion-wise Dice 0.02). Performance decreased for models trained on downsampled images, underscoring the value of native 7T resolution for small-lesion detection. By releasing our 7T-trained models, we aim to provide a reproducible, ready-to-use resource for automated lesion quantification in ultra-high field MS research (https://github.com/maynord/7T-MS-lesion-segmentation).
- Abstract(参考訳): 超高磁場 7-tesla (7T) MRI は多発性硬化症 (MS) の白質病変 (WML) の可視化を改善するが, 1.5-3T 画像とアーチファクトの対比は十分異なる。
我々は7T FLAIRスキャンと参照WMLマスクをLesion Segmentation Tool (LST)出力から解析し,その後,専門家の手による改訂を行った。
外部コンパレータとして,LST-LPAとLST-AIアンサンブルを適用した。
次に、7T FLAIR上の3次元UNETRおよびSegFormerトランスフォーマーモデル(0.5x0.5x0.5^3,1.0x1.0x1.0^3,1.5x1.5x2.0^3)を複数の解像度で訓練し、BraTS 2023フレームワークのボクセル・ワイドおよびコントラスト・ワイド・メトリックスを用いた全手法の評価を行った。
ネイティブ0.5x0.5x0.5^3解像度でのホールドアウト試験では、7TトレーニングしたトランスフォーマーがLST-AIと競合する結果を得た。
留置した7Tテストセットにおいて,我々の最良のトランスフォーマーモデル(SegFormer)は,従来のLST-LPAツール(Dice 0.39, lesion-wise Dice 0.02)を改良し,ボクセルワイドDiceの0.61と病変ワイドDiceの0.20を達成した。
ダウンサンプル画像に基づいてトレーニングされたモデルの性能は低下し、小さな競合検出のためのネイティブ7T解像度の値が強調された。
超高磁場MS研究(https://github.com/maynord/7T-MS-lesion-segmentation)において、7Tトレーニングモデルのリリースにより、自動病変定量化のための再現可能な、利用可能なリソースの提供を目指している。
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