論文の概要: Automated Prostate Gland Segmentation in MRI Using nnU-Net
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2604.01964v1
- Date: Thu, 02 Apr 2026 12:28:03 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-04-03 14:21:10.778973
- Title: Automated Prostate Gland Segmentation in MRI Using nnU-Net
- Title(参考訳): nnU-Netを用いたMRIにおける前立腺自動分割
- Authors: Pablo Rodriguez-Belenguer, Gloria Ribas, Javier Aquerreta Escribano, Rafael Moreno-Calatayud, Leonor Cerda-Alberich, Luis Marti-Bonmati,
- Abstract要約: 本稿では, nnUNet v2 フレームワークを用いた前立腺自動分節のためのディープラーニングに基づく専用アプローチを提案する。
提案したモデルでは、クロスバリデーションでは平均Diceスコアが0.96+/-0.00、外部テストセットでは0.82となり、ドメインシフトにもかかわらず強い一般化が示された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.14777718769290524
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Accurate segmentation of the prostate gland in multiparametric MRI (mpMRI) is a fundamental step for a wide range of clinical and research applications, including image registration, volume estimation, and radiomic analysis. However, manual delineation is time-consuming and subject to inter-observer variability, while general-purpose segmentation tools often fail to provide sufficient accuracy for prostate-specific tasks. In this work, we propose a dedicated deep learning-based approach for automatic prostate gland segmentation using the nnU-Net v2 framework. The model leverages multimodal mpMRI data, including T2-weighted imaging, diffusion-weighted imaging (DWI), and apparent diffusion coefficient (ADC) maps, to exploit complementary tissue information. Training was performed on 981 cases from the PI-CAI dataset using whole-gland annotations, and model performance was assessed through 5-fold cross-validation and external validation on an independent cohort of 54 patients from Hospital La Fe. The proposed model achieved a mean Dice score of 0.96 +/- 0.00 in cross-validation and 0.82 on the external test set, demonstrating strong generalization despite domain shift. In comparison, a general-purpose approach (TotalSegmentator) showed substantially lower performance, with a Dice score of 0.15, primarily due to under-segmentation of the gland. These results highlight the importance of task-specific, multimodal segmentation strategies and demonstrate the potential of the proposed approach for reliable integration into clinical research workflows. To facilitate reproducibility and deployment, the model has been fully containerized and is available as a ready-to-use inference tool.
- Abstract(参考訳): マルチパラメトリックMRI(mpMRI)における前立腺の正確なセグメンテーションは、画像登録、容積推定、放射線分析を含む幅広い臨床および研究応用の基本的なステップである。
しかし、手動のデライン化は時間を要するため、サーバ間変動の対象となるが、汎用セグメンテーションツールは、前立腺固有のタスクに対して十分な精度を提供できないことが多い。
本研究では, nnU-Net v2 フレームワークを用いた前立腺自動分節のための, ディープラーニングに基づく専用アプローチを提案する。
このモデルは、T2強調画像、拡散強調画像(DWI)、明らか拡散係数(ADC)マップなどのマルチモーダルmpMRIデータを利用して、相補的な組織情報を利用する。
PI-CAIデータセットから全粒度アノテーションを用いて981例のトレーニングを行い,5倍のクロスバリデーションと,La Fe病院からの54例の独立したコホートに対する外的検証によりモデル性能を評価した。
提案したモデルでは、クロスバリデーションでは平均Diceスコアが0.96+/-0.00、外部テストセットでは0.82となり、ドメインシフトにもかかわらず強い一般化が示された。
一方、汎用的アプローチ(TotalSegmentator)では、Diceスコアが0.15であり、腺の低セグメンテーションが主な原因であった。
これらの結果は、タスク固有のマルチモーダルセグメンテーション戦略の重要性を強調し、臨床研究ワークフローへの信頼性のある統合に向けた提案手法の可能性を示す。
再現性とデプロイメントを容易にするため、モデルは完全にコンテナ化され、使用可能な推論ツールとして利用できる。
関連論文リスト
- Longitudinal Vestibular Schwannoma Dataset with Consensus-based Human-in-the-loop Annotations [3.1898695141875772]
このデータセットには,184例のT1強調検査(T1CE)534例と6例の非アノテーションT2強調検査(T2強調検査)190例が含まれている。
提案手法は,自動セグメンテーションモデルの目的とするデータ分布への効率的かつ資源効率の高い一般化を可能にする。
従来の手作業による注釈処理と比較して、効率を約37.4%向上させると見積もられている。
論文 参考訳(メタデータ) (2025-11-01T09:53:28Z) - J-RAS: Enhancing Medical Image Segmentation via Retrieval-Augmented Joint Training [0.0]
本稿では,探索モデルとセグメンテーションモデルを統合したガイド画像セグメンテーションのジョイントトレーニング手法を提案する。
どちらのモデルも最適化されており、セグメンテーションモデルは取得した画像とマスクのペアを利用して解剖学的理解を深めることができる。
2つのベンチマークデータセット上で、U-Net、TransUNet、SAM、SegFormerを含む複数のセグメンテーションバックボーンにわたるJ-RASを検証する。
論文 参考訳(メタデータ) (2025-10-11T01:53:28Z) - A Multi-Stage Fine-Tuning and Ensembling Strategy for Pancreatic Tumor Segmentation in Diagnostic and Therapeutic MRI [7.8413564248632825]
本稿では、診断T1重み付け(Task1)と治療T2重み付け(Task2)の両方に対処するPANTHERチャレンジへの提案について詳述する。
我々のアプローチはnnU-Netフレームワーク上に構築されており、深いマルチステージの事前学習戦略を活用しています。
分析の結果,アグレッシブなデータ拡張によって高いボリューム精度が得られた,重要なトレードオフが明らかになった。
論文 参考訳(メタデータ) (2025-08-29T16:50:29Z) - An Arbitrary-Modal Fusion Network for Volumetric Cranial Nerves Tract Segmentation [21.228897192093573]
そこで我々は,CNTSeg-v2と呼ばれる,体積性頭蓋神経(CNs)の領域分割のための新しい任意モード核融合ネットワークを提案する。
我々のモデルは、他の補助モーダルから情報的特徴を効果的に抽出するために設計されたArbitrary-Modal Collaboration Module (ACM)を含んでいる。
我々のCNTSeg-v2は最先端のセグメンテーション性能を達成し、競合するすべての手法より優れています。
論文 参考訳(メタデータ) (2025-05-05T06:00:41Z) - Improving the U-Net Configuration for Automated Delineation of Head and Neck Cancer on MRI [0.0]
MRIにおける腫瘍体積のセグメンテーションは困難で時間を要するプロセスである。
本研究は,頭部および頸部腫瘍のMRI画像における自動デライン化へのアプローチを示す。
本研究の目的は,医学的セグメンテーションタスクで一般的に使用される構成の改善を提案することである。
論文 参考訳(メタデータ) (2025-01-09T10:22:35Z) - TotalSegmentator MRI: Robust Sequence-independent Segmentation of Multiple Anatomic Structures in MRI [59.86827659781022]
nnU-Netモデル(TotalSegmentator)をMRIおよび80原子構造で訓練した。
予測されたセグメンテーションと専門家基準セグメンテーションとの間には,ディススコアが算出され,モデル性能が評価された。
オープンソースで使いやすいモデルは、80構造の自動的で堅牢なセグメンテーションを可能にする。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-05-29T20:15:54Z) - DG-TTA: Out-of-domain Medical Image Segmentation through Augmentation and Descriptor-driven Domain Generalization and Test-Time Adaptation [43.842694540544194]
ドメイン外の画像に事前訓練された深層学習セグメンテーションモデルを適用すると、品質の不足を予測できる。
本研究では、拡張とともに強力な一般化記述子を用いて、ドメイン一般化事前学習とテスト時間適応を実現することを提案する。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-12-11T10:26:21Z) - Domain Transfer Through Image-to-Image Translation for Uncertainty-Aware Prostate Cancer Classification [42.75911994044675]
前立腺MRIの非対位画像翻訳のための新しいアプローチと臨床的に重要なPCaを分類するための不確実性認識トレーニングアプローチを提案する。
提案手法では,無ペアの3.0T多パラメータ前立腺MRIを1.5Tに翻訳し,利用可能なトレーニングデータを増強する。
実験の結果,提案手法は,従来の研究に比べてAUC(Area Under ROC Curve)を20%以上改善することがわかった。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-07-02T05:26:54Z) - Systematic Clinical Evaluation of A Deep Learning Method for Medical
Image Segmentation: Radiosurgery Application [48.89674088331313]
3次元医用画像分割作業において,Deep Learning (DL) 手法を体系的に評価した。
本手法は放射線外科治療プロセスに統合され,臨床ワークフローに直接影響を及ぼす。
論文 参考訳(メタデータ) (2021-08-21T16:15:40Z) - MS-Net: Multi-Site Network for Improving Prostate Segmentation with
Heterogeneous MRI Data [75.73881040581767]
本稿では,ロバスト表現を学習し,前立腺のセグメンテーションを改善するための新しいマルチサイトネットワーク(MS-Net)を提案する。
当社のMS-Netは,すべてのデータセットのパフォーマンスを一貫して改善し,マルチサイト学習における最先端の手法よりも優れています。
論文 参考訳(メタデータ) (2020-02-09T14:11:50Z)
関連論文リストは本サイト内にある論文のタイトル・アブストラクトから自動的に作成しています。
指定された論文の情報です。
本サイトの運営者は本サイト(すべての情報・翻訳含む)の品質を保証せず、本サイト(すべての情報・翻訳含む)を使用して発生したあらゆる結果について一切の責任を負いません。