論文の概要: DrugPlayGround: Benchmarking Large Language Models and Embeddings for Drug Discovery
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2604.02346v1
- Date: Wed, 11 Feb 2026 19:16:33 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-04-19 19:09:11.316049
- Title: DrugPlayGround: Benchmarking Large Language Models and Embeddings for Drug Discovery
- Title(参考訳): DrugPlayGround:ドラッグ発見のための大規模言語モデルと埋め込みのベンチマーク
- Authors: Tianyu Liu, Sihan Jiang, Fan Zhang, Kunyang Sun, Teresa Head-Gordon, Hongyu Zhao,
- Abstract要約: 大型言語モデル (LLMs) は、薬物発見研究の最前線にある。
DrugPlayGroundは、LCMのパフォーマンスを評価し、ベンチマークするフレームワークである。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 11.058244885471169
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Large language models (LLMs) are in the ascendancy for research in drug discovery, offering unprecedented opportunities to reshape drug research by accelerating hypothesis generation, optimizing candidate prioritization, and enabling more scalable and cost-effective drug discovery pipelines. However there is currently a lack of objective assessments of LLM performance to ascertain their advantages and limitations over traditional drug discovery platforms. To tackle this emergent problem, we have developed DrugPlayGround, a framework to evaluate and benchmark LLM performance for generating meaningful text-based descriptions of physiochemical drug characteristics, drug synergism, drug-protein interactions, and the physiological response to perturbations introduced by drug molecules. Moreover, DrugPlayGround is designed to work with domain experts to provide detailed explanations for justifying the predictions of LLMs, thereby testing LLMs for chemical and biological reasoning capabilities to push their greater use at the frontier of drug discovery at all of its stages.
- Abstract(参考訳): 大規模言語モデル(LLM)は、薬物発見の研究の上位にあり、仮説生成を加速し、候補の優先順位付けを最適化し、よりスケーラブルで費用対効果の高い薬物発見パイプラインを可能にすることにより、薬物研究を再形成する前例のない機会を提供している。
しかし、従来の薬物発見プラットフォームに対するその利点と限界を確かめるために、LLMのパフォーマンスを客観的に評価する能力が不足している。
創発的な問題に対処するため,我々は,生理化学的薬物特性,薬物相乗作用,薬物-タンパク質相互作用,および薬物分子による摂動に対する生理的応答について,有意義なテキストベースの記述を生成するためのLCM性能の評価とベンチマークを行うフレームワークであるDr.PlayGroundを開発した。
さらに、DarmPlayGroundはドメインの専門家と協力し、LSMの予測を正当化するための詳細な説明を提供するように設計されている。
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