論文の概要: MO-RiskVAE: A Multi-Omics Variational Autoencoder for Survival Risk Modeling in Multiple MyelomaMO-RiskVAE
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2604.06267v1
- Date: Tue, 07 Apr 2026 03:58:04 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-04-09 17:30:51.133941
- Title: MO-RiskVAE: A Multi-Omics Variational Autoencoder for Survival Risk Modeling in Multiple MyelomaMO-RiskVAE
- Title(参考訳): MO-RiskVAE:多発性骨髄腫-RiskVAEにおける生存リスクモデリングのための多機能変量オートエンコーダ
- Authors: Zixuan Chen, Heng Zhang, YuPeng Qin, WenPeng Xing, Qiang Wang, Da Wang, Changting Lin, Meng Han,
- Abstract要約: マルチモーダル変量オートエンコーダ (VAE) は多発性骨髄腫における生存リスクモデリングのための強力なフレームワークとして出現している。
数多くの派生案が提案されているが、この設定でどの側面がパフォーマンスを根本的に管理しているかははっきりしない。
生存駆動トレーニングは主に潜伏正規化の規模と構造に敏感であることを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 30.95113097758436
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Multimodal variational autoencoders (VAEs) have emerged as a powerful framework for survival risk modeling in multiple myeloma by integrating heterogeneous omics and clinical data. However, when trained under survival supervision, standard latent regularization strategies often fail to preserve prognostically relevant variation, leading to unstable or overly constrained representations. Despite numerous proposed variants, it remains unclear which aspects of latent design fundamentally govern performance in this setting. In this work, we conduct a controlled investigation of latent modeling choices for multimodal survival prediction within a unified extension of the MyeVAE framework. By systematically isolating regularization scale, posterior geometry, and latent space structure under identical architectures and optimization protocols, we show that survival-driven training is primarily sensitive to the magnitude and structure of latent regularization rather than the specific divergence formulation. In particular, moderate relaxation of KL regularization consistently improves survival discrimination, while alternative divergence mechanisms such as MMD and HSIC provide limited benefit without appropriate scaling. We further demonstrate that structuring the latent space can improve alignment between learned representations and survival risk gradients. A hybrid continuous--discrete formulation based on Gumbel--Softmax enhances global risk ordering in the continuous latent subspace, even though stable discrete subtype discovery does not emerge under survival supervision. Guided by these findings, we instantiate a robust multimodal survival model, termed MO-RiskVAE, which consistently improves risk stratification over the original MyeVAE without introducing additional supervision or complex training heuristics.
- Abstract(参考訳): マルチモーダル変量オートエンコーダ(VAE)は、異種オミクスと臨床データを統合することで、多発性骨髄腫における生存リスクモデリングの強力なフレームワークとして登場した。
しかし、生存監督下で訓練された場合、標準的な潜在正規化戦略は、しばしば予後に関連のある変動を保たず、不安定または過度に制約された表現をもたらす。
数多くの派生案が提案されているが、この設定でどの側面がパフォーマンスを根本的に管理しているかははっきりしない。
本研究では,MyeVAEフレームワークの統合拡張において,マルチモーダルサバイバル予測のための潜在モデル選択の制御を行う。
同一のアーキテクチャと最適化プロトコルの下で, 正則化スケール, 後続幾何学, 潜時空間構造を体系的に分離することにより, 生存駆動型トレーニングは, 特定の発散の定式化よりも, 潜時正規化の大きさや構造に主に敏感であることを示す。
特に、KL正則化の適度な緩和は生存の差別を一貫して改善する一方、MDDやHSICのような代替の分岐機構は適切なスケーリングをせずに限られた利益をもたらす。
さらに、潜在空間の構造化により、学習された表現と生存リスク勾配との整合性が向上することを示した。
Gumbel--Softmax に基づくハイブリッド型連続離散型定式化は、安定な離散型サブタイプ発見が生存監督下では発生しないにもかかわらず、連続潜伏部分空間における大域的リスク秩序を高める。
これらの知見により、我々はMO-RiskVAEと呼ばれる頑健なマルチモーダルサバイバルモデルをインスタンス化し、新たな監督や複雑なトレーニングヒューリスティックを導入することなく、元のMyeVAEに対するリスク階層化を継続的に改善する。
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