論文の概要: Predictive Modelling of Natural Medicinal Compounds for Alzheimer disease Using Machine Learning and Cheminformatics
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2604.18316v2
- Date: Sat, 25 Apr 2026 02:02:58 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-04-28 17:12:06.898472
- Title: Predictive Modelling of Natural Medicinal Compounds for Alzheimer disease Using Machine Learning and Cheminformatics
- Title(参考訳): 機械学習とケミノフォマティクスを用いたアルツハイマー病自然薬品の予測モデリング
- Authors: Hafiza Syeda Yusra Tirmizi, Syed Ibad Hasnain, Muhammad Faris, Rabail Khowaja, Saad Abdullah,
- Abstract要約: この研究は、天然化合物の抗Dementia活性を識別するための機械学習手法を提案した。
この研究は、ChEMBLやPubChemのような公共データベースから得られた活性化合物と不活性化合物のセットを使用した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Alzheimer disease (AD) is a neurodegenerative disease that lacks specific treatment options. Natural drugs have displayed neuroprotective effects; however, their high-throughput discovery is challenging because of the expense of experimental testing.The study proposed a machine learning approach to identify the anti-dementia activity of natural compounds based on molecular descriptors obtained from cheminformatics. The study used a set of active and inactive compounds obtained from public databases like ChEMBL and PubChem. Various molecular descriptors, including molecular weight, lipophilicity (LogP), topological polar surface area (TPSA), and hydrogen bonding descriptors, were calculated with RDKit. Data preprocessing and feature selection were applied, followed by the development of several classification models (Random Forest, XGBoost, Support Vector Machines, Logistic Regression) and their evaluation based on accuracy, precision, recall, F1-score and ROC-AUC. The outcome suggests that ensemble techniques, such as Random Forest, delivered the best predictive accuracy and ROC-AUC values. This study also highlights that critical physicochemical descriptors in particular lipophilicity, molecular weight and polarity are important in driving neuroprotective activity as identified by feature importance analysis. The integrated machine learning approach shows the potential of combining natural product research and machine learning in early drug discovery for dementia. They provide a means of rapidly exploring large datasets and selecting candidates for experimental confirmation, thus minimising costs and time in the development of drugs for neurodegenerative diseases.
- Abstract(参考訳): アルツハイマー病(英語: Alzheimer disease、AD)は、特定の治療法がない神経変性疾患である。
天然薬物は神経保護効果を示してきたが、その高スループットな発見は実験の費用がかかるため困難であり、この研究は、化学情報学から得られる分子記述子に基づく天然化合物の抗Dementia活性を同定する機械学習アプローチを提案した。
この研究は、ChEMBLやPubChemのような公共データベースから得られた活性化合物と不活性化合物のセットを使用した。
RDKitを用いて, 分子量, リポフィリシティ (LogP) , トポロジカル極面面積 (TPSA) , 水素結合性記述子などの分子記述子を計算した。
データ前処理と特徴選択が適用され、続いていくつかの分類モデル(Random Forest, XGBoost, Support Vector Machines, Logistic Regression)が開発され、精度、精度、リコール、F1スコア、ROC-AUCが評価された。
その結果、ランダムフォレストのようなアンサンブル技術が最高の予測精度とROC-AUCの値をもたらしたことが示唆された。
この研究は、特に脂質、分子量、極性における重要な物理化学的記述子は、特徴的重要性分析によって同定された神経保護活性を駆動する上で重要であることも強調した。
統合された機械学習アプローチは、認知症の初期薬物発見において、天然物の研究と機械学習を組み合わせる可能性を示している。
それらは、大規模なデータセットを迅速に探索し、実験的な確認候補を選択する手段を提供し、それによって神経変性疾患の薬物開発におけるコストと時間を最小化する。
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