論文の概要: COMO: Closed-Loop Optical Molecule Recognition with Minimum Risk Training
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2604.23546v1
- Date: Sun, 26 Apr 2026 05:48:21 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-04-28 17:12:07.424256
- Title: COMO: Closed-Loop Optical Molecule Recognition with Minimum Risk Training
- Title(参考訳): COMO:最小リスクトレーニングによる閉ループ光分子認識
- Authors: Zhuoqi Lyu, Qing Ke,
- Abstract要約: 光化学構造認識(OCSR)に最小リスクトレーニングを導入する
COMOは、分子レベルの非微分可能な目的を直接最適化することで、露光バイアスを緩和するクローズドループフレームワークである。
合成および実世界の化学図を含む10のベンチマーク実験では、COMOが既存のルールベースおよび学習ベースの手法を大幅に上回っていることが示されている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Optical chemical structure recognition (OCSR) translates molecular images into machine-readable representations like SMILES strings or molecular graphs, but remains challenging in real-world documents due to inexhaustible variations in chemical structures, shorthand conventions, and visual noise. Most existing deep-learning-based approaches rely on teacher forcing with token-level Maximum Likelihood Estimation (MLE). This training paradigm suffers from exposure bias, as models are trained under ground-truth prefixes but must condition on their own previous predictions during inference. Moreover, token-level MLE objectives hinder the optimization towards molecular-level evaluation criteria such as chemical validity and structural similarity. Here we introduce Minimum Risk Training (MRT) to OCSR and propose COMO (Closed-loop Optical Molecule recOgnition), a closed-loop framework that mitigates exposure bias by directly optimizing over molecule-level, non-differentiable objectives, by iteratively sampling and evaluating the model's own predictions. Experiments on ten benchmarks including synthetic and real-world chemical diagrams from patent and scientific literature demonstrate that COMO substantially outperforms existing rule-based and learning-based methods with less training data. Ablation studies further show that MRT is architecture-agnostic, demonstrating its potential for broad application to end-to-end OCSR systems.
- Abstract(参考訳): 光学化学構造認識 (OCSR) は、分子画像をSMILES文字列や分子グラフのような機械可読表現に変換するが、化学構造、短い規則、視覚ノイズの不確実な変化のために現実の文書では依然として困難である。
既存のディープラーニングベースのアプローチの多くは、トークンレベルの最大類似度推定(MLE)を強制する教師に頼っている。
この訓練パラダイムは、モデルが接頭辞の接頭辞の下で訓練されるため、露出バイアスに悩まされるが、推論中に以前の予測を条件にする必要がある。
さらに、トークンレベルのMLEは、化学的妥当性や構造的類似性といった分子レベルの評価基準への最適化を妨げている。
ここでは、最小リスクトレーニング(MRT)をOCSRに導入し、モデル自身の予測を反復的にサンプリングし評価することにより、分子レベルの非微分不可能な目的を直接最適化することにより、露光バイアスを緩和する閉ループフレームワークであるCOMO(Closed-loop Optical Molecule reOgnition)を提案する。
特許と科学文献からの合成および実世界の化学図を含む10のベンチマークの実験では、COMOが既存のルールベースおよび学習ベースの手法を、少ないトレーニングデータで大幅に上回っていることが示されている。
アブレーション研究により、MRTはアーキテクチャに依存しないことが示され、エンド・ツー・エンドのOCSRシステムへの幅広い応用の可能性を示している。
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