論文の概要: Learning Fingerprints for Medical Time Series with Redundancy-Constrained Information Maximization
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2605.00130v1
- Date: Thu, 30 Apr 2026 18:33:40 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-05-04 17:43:28.711103
- Title: Learning Fingerprints for Medical Time Series with Redundancy-Constrained Information Maximization
- Title(参考訳): 冗長制約情報最大化による医用時系列の学習
- Authors: Huayu Li, ZhengXiao He, Xiwen Chen, Jingjing Wang, Siyuan Tian, Jinghao Wen, Ao Li,
- Abstract要約: 可変長のMedTSを固定サイズの$k$潜在フィンガープリントトークンに圧縮する新しいフレームワークを提案する。
私たちのアーキテクチャでは、これらのトークンを生成するために、クロスアテンションボトルネックを使用し、二重目的関数でトレーニングされています。
このアプローチは低次元、解釈可能、サンプル効率の表現を生み出し、各トークンは変動の独立した要因を捉えることを奨励する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 11.233142317726971
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Learning meaningful representations from medical time series (MedTS) such as ECG or EEG signals is a critical challenge. These signals are often high-dimensional, variable-length and rife with noise. Existing self-supervised approaches, such as Masked Autoencoders (MAEs) are highly effective for pre-training general-purpose encoders. However, they do not explicitly learn compact and semantically interpretable latent representations, typically relying on heuristic aggregation strategies such as global average pooling or a designated [CLS] token. We propose a novel framework that compresses a variable-length MedTS into a fixed-size set of $k$ latent Fingerprint Tokens. Our architecture employs a cross-attention bottleneck to generate these tokens and is trained with a dual-objective function. The first objective is a reconstruction loss, which ensures the tokens are \textit{sufficient statistics} for the original data. The second, a diversity penalty based on the Total Coding Rate (TCR), explicitly minimizes the redundancy between tokens, encouraging them to become statistically \textit{disentangled} representations. We present the theoretical justification for our method, framing it as a novel \textbf{Disentangled Rate-Distortion} problem. This approach produces a low-dimensional, interpretable, and sample-efficient representation, where each token is encouraged to capture an independent factor of variation, paving the way for more robust digital biomarkers.
- Abstract(参考訳): ECGやEEG信号などの医療時系列(MedTS)から有意義な表現を学ぶことは重要な課題である。
これらの信号は、しばしば高次元、可変長、ノイズを伴う波動である。
Masked Autoencoders (MAE) のような既存の自己教師型アプローチは、事前訓練された汎用エンコーダに非常に効果的である。
しかし、大域平均プーリングや指定された[CLS]トークンのようなヒューリスティックアグリゲーション戦略に頼って、コンパクトで意味論的に解釈可能な潜在表現を明示的に学習するわけではない。
可変長のMedTSを固定サイズの$k$潜在フィンガープリントトークンに圧縮する新しいフレームワークを提案する。
私たちのアーキテクチャでは、これらのトークンを生成するために、クロスアテンションボトルネックを使用し、二重目的関数でトレーニングされています。
最初の目的は再構築損失であり、トークンが元のデータに対して \textit{sufficient statistics} であることを保証する。
2つ目は、トータル・コーディング・レート(TCR)に基づく多様性のペナルティであり、トークン間の冗長性を明示的に最小化し、統計的に \textit{disentangled} 表現になるよう促している。
本稿では,本手法の理論的正当性について,新しい「textbf{Disentangled Rate-Distortion}」問題として考察する。
このアプローチは低次元、解釈可能、サンプル効率の表現を生み出し、それぞれのトークンは独立した変動要因を捉え、より堅牢なデジタルバイオマーカーの道を開く。
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