論文の概要: From Trajectories to Phenotypes: Disease Progression as Structural Priors for Multi-organ Imaging Representation Learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2605.11958v1
- Date: Tue, 12 May 2026 11:10:26 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-05-13 21:48:56.812375
- Title: From Trajectories to Phenotypes: Disease Progression as Structural Priors for Multi-organ Imaging Representation Learning
- Title(参考訳): トラジェクトリーからフェノタイプへ:多臓器画像表現学習における構造的優先事項としての疾患の進展
- Authors: Zian Wang, Lizhen Lan, Guangming Wang, Haosen Zhang, Minxuan Xu, Qing Li, Tianxing He, Mo Yang, Wenyue Mao, Yajing Zhang, Yan Li, Chengyan Wang,
- Abstract要約: 本稿では, 臓器関連IDPエンコーダに構造知識を変換するトラジェクティブ・アウェア・フレームワークを提案する。
英国バイオバンクのコホートでは159の疾患が発生し、トラジェクトリ・アウェア・プレトレーニングにより、識別と発症予測の両方が一貫して改善される。
以上の結果から, 人口規模で生成する疾患モデルが, データ制限画像モダリティの構造的先行要因となる可能性が示唆された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 22.146397986514604
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Imaging-derived phenotypes (IDPs) summarize multi-organ physiology but provide only static snapshots of diseases that evolve over time. In contrast, longitudinal electronic health records encode disease trajectories through temporal dependencies among past diagnosis events and comorbidity structure. We hypothesize that IDPs and disease trajectories contain partially shared disease-relevant structure. We propose a trajectory-aware distillation framework that transfers structural knowledge from a generative disease trajectory Transformer into an organ-wise IDP encoder. A population-scale trajectory model trained on longitudinal diagnosis sequences produces subject-level embeddings that supervise IDP representation learning via geometry-preserving alignment. During downstream prediction, trajectory and imaging representations can also be fused via cross-attention. Across 159 diseases in the UK Biobank cohort, trajectory-aware pretraining consistently improves both discrimination (AUC) and time-to-onset prediction (MAE), with the largest gains for low-prevalence diseases. Similarity relationships in IDP embedding space also align with those in trajectory space, providing supportive evidence for partially aligned representation geometry. These results suggest that population-scale generative disease models can serve as structural priors for data-limited imaging modalities, improving robustness under realistic cohort constraints.
- Abstract(参考訳): イメージング由来の表現型(IDP)は、多臓器生理学を要約するが、時間とともに進化する疾患の静的スナップショットのみを提供する。
対照的に、縦断的な電子健康記録は、過去の診断イベントと協調構造の間の時間的依存関係を通じて、疾患の軌跡を符号化している。
我々はIDPと疾患軌跡が部分的に共有された疾患関連構造を含んでいると仮定する。
本稿では, 発生性疾患のトラジェクトリトランスフォーマーから臓器関連IDPエンコーダへ構造的知識を伝達するトラジェクトリ対応蒸留フレームワークを提案する。
縦断的診断シーケンスに基づいて訓練された集団規模軌跡モデルにより、幾何学保存アライメントによるIDP表現学習を監督する対象レベルの埋め込みを生成する。
下流での予測では、軌跡や画像の表現も相互注意によって融合することができる。
英国バイオバンクのコホートにおける159の疾患のうち、トラジェクトリ・アウェア・プレトレーニングは、差別(AUC)とタイム・ツー・オンセット予測(MAE)の両方を継続的に改善する。
IDP埋め込み空間の類似性関係は軌道空間の類似性とも一致し、部分整列表現幾何学の支持的な証拠を与える。
以上の結果から, 人口規模で生成する疾患モデルが, データ制限による画像モダリティの構造的先行要因となり, 現実的なコホート制約下でのロバスト性の向上が示唆された。
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