論文の概要: MedHopQA: A Disease-Centered Multi-Hop Reasoning Benchmark and Evaluation Framework for LLM-Based Biomedical Question Answering
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2605.12361v1
- Date: Tue, 12 May 2026 16:32:43 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-05-13 21:48:57.013545
- Title: MedHopQA: A Disease-Centered Multi-Hop Reasoning Benchmark and Evaluation Framework for LLM-Based Biomedical Question Answering
- Title(参考訳): MedHopQA: LLMに基づくバイオメディカル質問応答のための病気中心型マルチホップ推論ベンチマークと評価フレームワーク
- Authors: Rezarta Islamaj, Robert Leaman, Joey Chan, Nicholas Wan, Qiao Jin, Natalie Xie, John Wilbur, Shubo Tian, Lana Yeganova, Po-Ting Lai, Chih-Hsuan Wei, Yifan Yang, Yao Ge, Qingqing Zhu, Zhizheng Wang, Zhiyong Lu,
- Abstract要約: MedHopQAは、1000の専門家による質問応答ペアからなる、疾患中心のマルチホップ推論ベンチマークである。
各質問はウィキペディアの異なる2つの記事にまたがる情報の合成を必要とし、回答はオープンエンドのフリーテキスト形式で提供される。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 11.3883842897598
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Evaluating large language models (LLMs) in the biomedical domain requires benchmarks that can distinguish reasoning from pattern matching and remain discriminative as model capabilities improve. Existing biomedical question answering (QA) benchmarks are limited in this respect. Multiple-choice formats can allow models to succeed through answer elimination rather than inference, while widely circulated exam-style datasets are increasingly vulnerable to performance saturation and training data contamination. Multi-hop reasoning, defined as the ability to integrate information across multiple sources to derive an answer, is central to clinically meaningful tasks such as diagnostic support, literature-based discovery, and hypothesis generation, yet remains underrepresented in current biomedical QA benchmarks. MedHopQA is a disease-centered multi-hop reasoning benchmark consisting of 1,000 expert-curated question-answer pairs introduced as a shared task at BioCreative IX. Each question requires synthesis of information across two distinct Wikipedia articles, and answers are provided in an open-ended free-text format. Gold annotations are augmented with ontology-grounded synonym sets from MONDO, NCBI Gene, and NCBI Taxonomy to support both lexical and concept-level evaluation. MedHopQA was constructed through a structured process combining human annotation, triage, iterative verification, and LLM-as-a-judge validation. To reduce leaderboard gaming and contamination risk, the 1,000 scored questions are embedded within a publicly downloadable set of 10,000 questions, with answers withheld, on a CodaBench leaderboard. MedHopQA provides both a benchmark and a reusable framework for constructing future biomedical QA datasets that prioritize compositional reasoning, saturation resistance, and contamination resistance as core design constraints.
- Abstract(参考訳): バイオメディカル領域における大規模言語モデル (LLM) の評価には、パターンマッチングと推論を区別し、モデル能力の向上とともに識別性を維持するベンチマークが必要である。
既存のQAベンチマークは、この点で制限されている。
複数の選択形式は、推論よりも解答によるモデルの成功を可能にする一方で、広く流通する試験スタイルのデータセットは、パフォーマンス飽和やデータ汚染のトレーニングにますます脆弱である。
マルチホップ推論は、複数のソースにまたがって情報を統合して回答を導き出す能力として定義され、診断支援、文献に基づく発見、仮説生成といった臨床的に意味のあるタスクの中心であるが、現在の生物医学的QAベンチマークでは未定である。
MedHopQAは、BioCreative IXで共有タスクとして導入された1000の専門家による質問応答ペアからなる、疾患中心のマルチホップ推論ベンチマークである。
各質問はウィキペディアの異なる2つの記事にまたがる情報の合成を必要とし、回答はオープンエンドのフリーテキスト形式で提供される。
金のアノテーションは、Mondo、NCBI Gene、NCBI Taxonomyのオントロジーに基づくシノニムセットで強化され、語彙と概念レベルの評価の両方をサポートする。
MedHopQAは、人間のアノテーション、トリアージ、反復検証、LCM-as-a-judgeバリデーションを組み合わせた構造化プロセスによって構築された。
リーダーボードのゲームと汚染リスクを減らすため、1000件の質問は、公開ダウンロード可能な1万件の質問に埋め込まれ、回答はそのままCodaBenchのリーダーボードに埋め込まれている。
MedHopQAは、将来のバイオメディカルQAデータセットを構築するためのベンチマークと再利用可能なフレームワークの両方を提供する。
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