論文の概要: FederatedRSF : Federated Random Survival Forests for Partially Overlapping Medical Data
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2605.22954v1
- Date: Thu, 21 May 2026 18:32:25 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-05-25 17:29:20.058478
- Title: FederatedRSF : Federated Random Survival Forests for Partially Overlapping Medical Data
- Title(参考訳): フェデレートRSF : 部分的に重複する医療データのためのフェデレーションランダム生存林
- Authors: Maryam Moradpour, Jonas Harriehausen, Amirreza Aleyasin, Lion Philipp Wolf, Youngjun Park, Anne-Christin Hauschild,
- Abstract要約: フェデレートRSFは、ランダムサバイバル森林を実装し、地元で訓練されたサバイバルツリーを集約し、各場所に特徴互換の木のみを再配布する。
GBSG2乳がんコホートにおけるFederatedRSFとScikit-survival packageの併用効果について検討した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.0303353919699785
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Multi-center survival prediction can improve robustness and generalizability, yet privacy regulations and institutional governance often prevent pooling patient-level clinical and genomic data across institutions. In practice, deployment is further complicated by feature-space heterogeneity, in which sites collect different covariates or use different sequencing panels, resulting in only partially overlapping feature sets. We present FederatedRSF, a Python package that implements federated random survival forests, aggregating locally trained survival trees and redistributing only feature-compatible trees to each site, enabling inference with partial overlap without sharing raw data. We evaluate FederatedRSF on the GBSG2 breast cancer cohort distributed with the scikit-survival package, simulating feature heterogeneity across clients by withholding subsets of features, and assessing discrimination using Harrell's concordance index (C-Index) under repeated cross-validation and site-splits. The results demonstrated that the federated model can achieve performance comparable to that of the centralized training setting.
- Abstract(参考訳): マルチセンターサバイバル予測は、堅牢性と一般化性を改善することができるが、プライバシ規制と制度的ガバナンスは、しばしば患者レベルの臨床およびゲノムデータのプールを防ぐ。
実際には、サイトが異なる共変量を収集したり、異なるシークエンシングパネルを使用するという特徴空間の不均一性により、デプロイはさらに複雑になる。
我々は、フェデレートされたランダムサバイバル森林を実装したPythonパッケージであるFederatedRSFを紹介し、ローカルに訓練されたサバイバルツリーを集約し、各サイトに機能互換ツリーのみを再配布し、生データを共有することなく部分的なオーバーラップによる推論を可能にする。
我々は,GBSG2乳がんコホートにおけるFederatedRSFの評価を行い,特徴のサブセットを保留することで,クライアント間の特徴の不均一性をシミュレートし,繰り返しのクロスバリデーションとサイトスプリットによるHarrellのコンコーダンス指標(C-Index)を用いた識別を評価する。
その結果,フェデレートされたモデルでは,集中的なトレーニング設定と同等の性能が得られることがわかった。
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