論文の概要: AutoScientists: Self-Organizing Agent Teams for Long-Running Scientific Experimentation

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2605.28655v1
• Date: Wed, 27 May 2026 15:56:12 GMT
• ステータス: 翻訳完了
• システム内更新日: 2026-05-28 17:38:56.193404
• Title: AutoScientists: Self-Organizing Agent Teams for Long-Running Scientific Experimentation
• Title（参考訳）: AutoScientists: 長期にわたる科学実験のための自己組織化エージェントチーム
• Authors: Shanghua Gao, Ada Fang, Marinka Zitnik,
• Abstract要約: AutoScientistsは、長期的な計算科学実験のためのAIエージェントの分散チームである。 エージェントは共有された実験状態を解釈し、実験計算を使用する前に、有望な仮説、批判的な提案に関するチームに自己組織化する。 一致した実験予算の下で、AutoScientistsは、バイオメディカル機械学習、言語モデルトレーニング最適化、タンパク質の適合性予測など、AIエージェントを改良する。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 28.790523063833376
• License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
• Abstract: Scientific research proceeds through iterative cycles of hypothesis generation, experiment design, execution, and revision. AI agents can automate parts of this process, but existing approaches typically follow a single research trajectory or coordinate through a central planner with fixed objectives. As a result, they struggle to sustain parallel exploration, adapt as experimental evidence changes, or preserve knowledge of failed directions over long-running experiments. We introduce AutoScientists, a decentralized team of AI agents for long-running computational scientific experimentation. Agents interpret a shared experimental state, self-organize into teams around promising hypotheses, critique proposals before using experimental compute, and share successes and failures to reduce redundant exploration. Under matched experimental budgets, AutoScientists improves over prior AI agents across biomedical machine learning, language-model training optimization, and protein fitness prediction. On BioML-Bench, spanning biomedical imaging, protein engineering, single-cell omics, and drug discovery, AutoScientists achieves a mean leaderboard percentile of 74.4% across 24 tasks, improving over the strongest AI agent by +8.33%. On GPT training optimization, AutoScientists reaches a target validation bits-per-byte 1.9x faster than Autoresearch and continues discovering improvements from a starting champion where the single-agent approach finds none (7 vs. 0 accepted improvements). On ProteinGym fitness prediction, AutoScientists discovers a method for ACE2-Spike binding that improves over the current state-of-the-art model by +12.5% in Spearman correlation. Applied without modification across all 217 ProteinGym assays, the same method improves over the prior state of the art by +6.5% (Spearman correlation).
• Abstract（参考訳）: 科学的研究は仮説生成、実験設計、実行、修正を繰り返している。 AIエージェントは、このプロセスの一部を自動化することができるが、既存のアプローチは通常、単一の研究軌跡に従うか、固定された目的を持った中央プランナーを通してコーディネートする。 その結果、彼らは平行探索を継続したり、実験的な証拠の変化に適応したり、長期にわたる実験よりも失敗した方向の知識を維持するのに苦労した。 我々は、長期的な計算科学実験のためのAIエージェントの分散チームであるAutoScientistsを紹介する。 エージェントは共有された実験状態を解釈し、有望な仮説、実験計算を使用する前に提案を批判し、冗長な探索を減らすために成功と失敗を共有する。 一致した実験予算の下で、AutoScientistsは、バイオメディカル機械学習、言語モデルトレーニング最適化、タンパク質の適合性予測など、AIエージェントを改良する。 BioML-Benchでは、バイオメディカルイメージング、タンパク質工学、単細胞オミクス、薬物発見を網羅して、AutoScientistsは24のタスクで74.4%の平均リーダーボードパーセンタイルを達成し、+8.33%のAIエージェントよりも改善している。 GPTトレーニングの最適化において、AutoScientistsはAutoresearchよりも1.9倍高速なターゲット検証ビットに到達し、シングルエージェントアプローチが(0対0の許容された改善)何も見つからないスターティングチャンピオンから改善を発見し続けている。 タンパク質Gymの適合度予測では、AutoScientistsはACE2-Spike結合の方法を発見し、スピアマン相関において現在の最先端モデルよりも+12.5%向上する。 217個のタンパク質Gymアッセイを変更せずに適用すると、この手法は以前の最先端を+6.5%改善する(スピアマン相関)。

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