論文の概要: Agentic Authoring of Interactive Multiview Visualizations in Genomics
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2606.00370v1
- Date: Fri, 29 May 2026 21:22:16 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-06-02 21:34:28.366123
- Title: Agentic Authoring of Interactive Multiview Visualizations in Genomics
- Title(参考訳): ゲノミクスにおける対話型マルチビュー可視化のエージェントオーサリング
- Abstract要約: エージェントおよび大規模言語モデル(LLM)アプローチは、複雑な科学的タスクにますます適用されている。
自然言語の会話インタフェースは、複雑な視覚化の著者を民主化するための有望な道を提供する。
ゲノムヴィジュアライゼーションは異種データ型を統合し、複数のリンクされたインタラクティブビューで構成されている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 10.74947096548303
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Diverse genomics data, scientific questions, and analysis tasks typically demand highly specialized visualizations. Therefore, users often must customize or author new ones tailored to their data. Existing tools are usually either limited in customization or require substantial learning or programming, and even expressive tools assume visualization expertise many users lack. Agentic and large language model (LLM) approaches are increasingly applied to complex scientific tasks, including visualization. Natural-language conversational interfaces offer a promising path to democratizing the authoring of complex visualizations. In the context of genomics, these approaches face additional challenges: genomics visualizations typically integrate heterogeneous data types and are composed of multiple linked interactive views. These challenges motivate more structured LLM-based schemes. We first characterize where vanilla LLM generation succeeds and fails for genomics visualization, identifying eight quality dimensions. We then compare six schemes--direct generation, a fixed pipeline, and four agentic configurations varying in the number of specialist agents and the presence of a reviewer--across 159 cases spanning three levels of query ambiguity and specification complexity. All schemes use the Gosling visualization grammar as structured output. Agentic iteration substantially improves perceived quality over both baselines, while more complex agent architectures yield no additional benefit. We discuss implications for designing agentic systems for domain-specific visualization authoring. All supplemental materials are available at https://osf.io/uqe83.
- Abstract(参考訳): 異種ゲノムデータ、科学的問題、分析タスクは通常、高度に専門的な視覚化を必要とする。
そのため、ユーザーはデータに合わせてカスタマイズしたり、新しいものを書いたりしなければならないことが多い。
既存のツールは通常、カスタマイズに制限されるか、実質的な学習やプログラミングを必要とする。
エージェントおよび大規模言語モデル(LLM)アプローチは、可視化を含む複雑な科学的タスクにますます適用されている。
自然言語の会話インタフェースは、複雑な視覚化の著者を民主化するための有望な道を提供する。
ゲノムヴィジュアライゼーションは通常、異種データ型を統合し、複数のリンクされたインタラクティブビューで構成されます。
これらの課題は、より構造化されたLCMベースのスキームを動機付けている。
まず、バニラLLM生成が成功し、ゲノミクスの可視化に失敗し、8つの品質次元を識別する点を特徴付ける。
次に、クエリのあいまいさと仕様の複雑さの3つのレベルにまたがる159のケースにおいて、専門家の数やレビュアーの存在によって異なる6つのエージェント構成をダイレクトジェネレーション、固定パイプライン、および4つのエージェント構成と比較する。
すべてのスキームは、構造化された出力としてGosling視覚化文法を使用する。
エージェント反復は、両方のベースラインよりも認識される品質を大幅に改善する一方、より複雑なエージェントアーキテクチャは追加の利益を得られない。
ドメイン固有の可視化オーサリングのためのエージェントシステムを設計することの意味について論じる。
すべての追加資料はhttps://osf.io/uqe83.comで入手できる。
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