論文の概要: Learning Sparse Latent Predictive Foundation Model for Multimodal Neuroimaging
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2606.14957v2
- Date: Thu, 18 Jun 2026 14:47:30 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-06-19 13:55:51.506003
- Title: Learning Sparse Latent Predictive Foundation Model for Multimodal Neuroimaging
- Title(参考訳): マルチモーダル・ニューロイメージングのためのスパース潜在予測基礎モデル
- Authors: Haoxu Huang, Long Chen, Jingyun Chen, Jinu Hyun, James Ryan Loftus, Kara Melmed, Daniel Orringer, Jennifer Frontera, Seena Dehkharghani, Arjun Masurkar, Narges Razavian,
- Abstract要約: 我々は、コアT1w、T2w、および流体抑制FLAIRイメージング(FLAIR)で脳MRIを符号化するスパースマルチモーダル・ニューロイメージング基盤モデルであるNeuro-JEPAを紹介した。
ニューロJEPAは、3つのコア構造脳MRIシークエンスにデータキュレーションを施したモダリティ特異的前処理の後、428,647件の1,551,862件のスキャンで事前訓練された。
3つの健康システムから25のタスクを含む臨床・研究環境における学習表現の評価を行った。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.655046812740412
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Brain MRIs are routinely acquired as multiple complementary sequences with unique contrast weighting, including T1-weighed imaging (T1w) anatomic and fluid-sensitive T2-weighted (T2w) contrasts. However, methods for learning unified representations across the multitude of MRI contrast mechanisms at health-system scale are lacking. In this study, we introduce Neuro-JEPA, a sparse multimodal neuroimaging foundation model that combines a latent predictive objective with a Mixture-of-Experts architecture to encode brain MRI across core T1w, T2w, and fluid-suppressed FLAIR imaging (FLAIR). We further provide a systematic methodological study of architectural, masking, objective, and sparsity design choices beneficial for robust neuroimaging multimodal representation learning. Neuro-JEPA was pretrained on 1,551,862 scans from 428,647 studies after modality-specific preprocessing with data curation across three core structural brain MRI sequences. We evaluated the learned representations across clinical and research settings, including 25 tasks from three health systems: NYU Langone, NYU Long Island, and Massachusetts General Hospital, and 22 tasks from 12 public datasets, covering unimodal, multimodal and cross-domain evaluation configurations. Across these benchmarks, existing neuroimaging foundation models showed inconsistent gains over a simple convolutional neural network (CNN) baseline, whereas Neuro-JEPA achieved stronger and more consistent performance across all evaluated settings. These results establish a scalable methodological framework for multimodal neuroimaging representation learning and highlight the need for foundation model evaluation protocols that include simple baselines, clinically heterogeneous cohorts and controlled multimodal comparisons.
- Abstract(参考訳): 脳MRIは、T1-weighed imaging (T1w) anatomic and fluid-sensitive T2-weighted (T2w) contrastsを含む、ユニークなコントラスト重みを持つ複数の補完配列として日常的に取得される。
しかし、医療システム規模でのMRIコントラスト機構の多種多様にわたる統一表現の学習方法は欠如している。
本研究では,脳MRIをコアT1w,T2w,流体抑制FLAIRイメージング(FLAIR)でエンコードするMixture-of-Expertsアーキテクチャと,潜伏予測対象を結合したスパースマルチモーダル・ニューロイメージング基盤モデルであるNeuro-JEPAを紹介する。
さらに、ロバスト・ニューロイメージング・マルチモーダル表現学習に有用なアーキテクチャ、マスキング、目的、およびスパーシティデザインの選択に関する体系的研究を行った。
ニューロJEPAは、3つのコア構造脳MRIシークエンスにデータキュレーションを施したモダリティ特異的前処理の後、428,647件の1,551,862件のスキャンで事前訓練された。
対象は,ニューヨーク・ラングーン,ニューヨーク・ロングアイランド,マサチューセッツ・ジェネラル病院の3つの健康システムから25のタスク,および12のパブリックデータセットから22のタスクを対象とし,単調,マルチモーダル,クロスドメインの評価設定を対象とした。
これらのベンチマーク全体において、既存のニューロイメージング基礎モデルは、単純な畳み込みニューラルネットワーク(CNN)ベースラインよりも一貫性のない向上を示し、一方、Neuro-JEPAは、評価されたすべての設定に対してより強く、より一貫性のあるパフォーマンスを達成した。
これらの結果は,マルチモーダルなニューロイメージング表現学習のためのスケーラブルな方法論的枠組みを確立し,シンプルなベースライン,臨床的に異質なコホート,制御されたマルチモーダル比較を含む基礎モデル評価プロトコルの必要性を強調した。
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