論文の概要: A Human-in-the-Loop Bayesian Optimization Framework for Constraint-Aware Bioprocess Development
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2606.19230v1
- Date: Wed, 17 Jun 2026 16:06:41 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-06-18 17:16:51.259547
- Title: A Human-in-the-Loop Bayesian Optimization Framework for Constraint-Aware Bioprocess Development
- Title(参考訳): 制約を考慮したバイオプロセス開発のための人間型ベイズ最適化フレームワーク
- Authors: Samuel Stricker, Claus Wirnsperger, Alessandro Butté, Laura Helleckes, Gonzalo Guillén Gosálbez, Antonio del Rio Chanona, Mehmet Mercangöz,
- Abstract要約: この研究は、HitL(Human-in-the-Loop) Bayesian Optimization (BO)フレームワークの拡張を示す。
ドメインエキスパートは、単一の自動化されたレコメンデーションを返すのではなく、対話的な候補選択のためにドメインエキスパートに公開されます。
このフレームワークは8次元のFed-batch Chinese Hamster Ovary (CHO)細胞培養シミュレータで展示されている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 33.72751145910978
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: This work presents an extension to Pareto Front Guided Sampling (PFGS), a Human-in-the-Loop (HitL) Bayesian Optimization (BO) framework in which Gaussian process (GP) surrogate-derived quantities are reformulated as objectives of a multi-objective optimization problem, and the resulting Pareto front is exposed to a domain expert for interactive candidate selection rather than returning a single automated recommendation. The framework is extended in two directions: constrained optimization is addressed by incorporating the posterior probability of satisfying output specification limits as an explicit Pareto objective, computed analytically from the GP posterior distribution; robust optimization is addressed by a Monte Carlo sampling strategy that estimates expected lower-confidence performance over a user-defined variability of input perturbations, capturing performance degradation under likely implementation deviations. The resulting multi-dimensional Pareto representation renders trade-offs between predicted performance, model uncertainty, probabilistic constraint satisfaction, and input robustness simultaneously visible through pairwise two-dimensional projections on an interactive dashboard, enabling selection criteria to be iteratively refined as the surrogate model improves and development objectives evolve. The framework is showcased on an eight-dimensional fed-batch Chinese Hamster Ovary (CHO) cell culture simulator demonstrating systematic identification of high-performing, feasibility-compliant, and perturbation-resilient operating conditions, and illustrating how expert-defined requirements provide a principled stopping criterion and support informed allocation of experimental resources.
- Abstract(参考訳): 本研究は,多目的最適化問題の目的として,ガウス過程(GP)シュロゲート由来の量を再構成したHuman-in-the-Loop (HitL) Bayesian Optimization (BO)フレームワークであるPareto Front Guided Smpling (PFGS)の拡張を提示する。
このフレームワークは2つの方向に拡張されている: 制約付き最適化は、出力仕様の限界を満たす後続確率を明示的なパレートの目的として、GP後部分布から解析的に計算され、ロバスト最適化は、入力摂動のユーザ定義の可変性よりも低い信頼度性能を推定するモンテカルロサンプリング戦略によって対処される。
結果として得られる多次元パレート表現は、予測性能、モデル不確実性、確率的制約満足度、および対話型ダッシュボード上で2次元の2次元投影を通して同時に見える入力ロバスト性の間のトレードオフを表現し、サロゲートモデルの改善と開発目標の進化に伴って選択基準を反復的に洗練することを可能にする。
このフレームワークは、8次元のFed-batch Chinese Hamster Ovary (CHO) 細胞培養シミュレータで、ハイパフォーマンス、フィージビリティ準拠、摂動耐性の動作条件の体系的同定を実証し、専門家が定義した要件が、実験資源の原則的な停止基準と情報割り当てをサポートする方法を示す。
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