論文の概要: Interpretable Probabilistic Medical Image Segmentation via Gaussian Process with Explicit Modelling of Annotation Bias and Variability
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2606.23177v1
- Date: Mon, 22 Jun 2026 11:14:26 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-06-24 23:37:21.478662
- Title: Interpretable Probabilistic Medical Image Segmentation via Gaussian Process with Explicit Modelling of Annotation Bias and Variability
- Title(参考訳): 注釈バイアスと変数の明示的モデリングによるガウス過程による可逆的医用画像分割の解釈
- Authors: Qi Li, Yuliang Huang, Shaheer U. Saeed, Qianye Yang, Vasilis Stavrinides, Zachary M. C. Baum, Dean C. Barratt, J. Alison Noble, Tom Vercauteren, Yipeng Hu,
- Abstract要約: 本稿では,予測を画像依存の参照ロジット分布とアノテータ固有の摂動に分解するロジット空間確率的セグメンテーションフレームワークを提案する。
本手法をマルチアノテータの医用画像データセット上で評価し,アノテータ固有の摂動を明示的にモデル化することで不確実性の校正が向上することを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 14.53294799919725
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Deep learning-based medical image segmentation models are trained using annotations that exhibit systematic bias and variability across raters. While probabilistic multi-rater approaches can emulate annotator-specific delineations, annotator characteristics are typically encoded implicitly in deep latent feature space, making direct analysis of their influence on predictive distributions less straightforward. We propose a logit-space probabilistic segmentation framework based on stochastic variational Gaussian Process that explicitly decomposes predictions into an image-dependent reference logit distribution and annotator specific perturbations parameterised by bias and variance. This formulation enables more explicit analysis on how intra- and inter-rater variability propagate to predictive distributions. We evaluate the method on a multi-annotator medical image dataset, which shows that explicitly modelling annotator specific perturbations improves uncertainty calibration while maintaining comparable segmentation accuracy, compared with state-of-the-art multi-rater probabilistic segmentation method. The learned bias and variance parameters quantitatively reflect annotator-specific behaviour. Furthermore, controlled perturbation experiments over bias and variance demonstrate how changes in annotator parameters systematically influence predictive performance. The code used in this paper is made publicly available at https://github.com/QiLi111/GPS-Var.
- Abstract(参考訳): ディープラーニングに基づく医療画像セグメンテーションモデルは、ラッカー間の系統的なバイアスと変動を示すアノテーションを使用して訓練される。
確率的マルチラターアプローチは、アノテータ固有の記述をエミュレートすることができるが、アノテータの特徴は通常、深い潜在特徴空間において暗黙的に符号化され、予測分布に対するそれらの影響を直接解析する。
本稿では,確率的変動ガウス過程に基づくロジット空間の確率的セグメンテーションフレームワークを提案する。
この定式化により、予測分布に対して、層内および層間変動がどのように伝播するかをより明確な分析が可能となる。
本手法をマルチアノテータの医用画像データセット上で評価した結果,アノテータ固有の摂動を明示的にモデル化することで,高いセグメンテーション精度を維持しながら不確かさのキャリブレーションが向上することが示された。
学習されたバイアスと分散パラメータは、アノテータ固有の振る舞いを定量的に反映する。
さらに、バイアスと分散に関する制御摂動実験は、アノテータパラメータの変化が予測性能に体系的にどう影響するかを示す。
この論文で使用されたコードはhttps://github.com/QiLi111/GPS-Var.comで公開されている。
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