論文の概要: CaresAI at SMM4H-HeaRD 2026: Predicting TNM Staging
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2607.03466v1
- Date: Fri, 03 Jul 2026 16:25:35 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-07-07 22:26:29.626152
- Title: CaresAI at SMM4H-HeaRD 2026: Predicting TNM Staging
- Title(参考訳): SMM4H-HeaRD 2026のCaresAI: TNMのステージング予測
- Authors: Joseph Itopa Abubakar, Jorge Jarme, Favour Igwezeke, Mary Adewunmi,
- Abstract要約: 本研究は,SMM4H-HeaRD 2026の6番目の共有タスクとして癌ゲノムアトラス(TCGA)を報告し,腫瘍,リンパ節,転移(TNM)ステージラベルを独立に予測することを目的としている。
本稿では,TF-IDF(Term Frequency-Inverse Document Frequency)機能を用いた古典的および深層学習のアプローチと,CeriorBERT,BioBERT,PubMedBERTの埋め込みについて検討する。
以上の結果から,TNMラベルの分類と同様の埋め込みが可能である一方で,それらの組み合わせによって予測能力が向上することが示唆された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.7998963147546143
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: This study aims to predict Tumor, Node, and Metastasis (TNM) stage labels independently, with the Cancer Genome Atlas (TCGA) pathology report as the sixth shared task of SMM4H-HeaRD 2026. The problem is framed as three multi-label classification tasks. We explore both classical and deep learning approaches using Term Frequency-Inverse Document Frequency (TF-IDF) features and embeddings from ClinicalBERT, BioBERT, and PubMedBERT. These representations are used with Logistic Regression (LR), Light Gradient Boosting Machine (LightGBM), Feed-Forward Neural Networks (FFNN), and Wide Residual Networks (WRN). Our results show that individual embeddings perform similarly to the TNM label classification, while their combination improves its predictive ability. WRN achieves AUROC scores of 0.839 (T), 0.8502 (N), and 0.803 (M) with F1-scores of 0.622, 0.702, and 0.9337, respectively, for the training phase. LightGBM with TF-IDF performs best with AUROC scores of 0.9368 (T), 0.9524 (N), and 0.8311 (M) and F1-scores of 0.7559 (T), 0.7384 (N), and 0.7017 (M) during the training phase. Furthermore, the result of the Codabench for the test sets indicates a Macro-F1 score of 0.978, 0.957, and 0.879 for the T, N, and M categories respectively for test set 1; while test set 2 records a Macro-F1 score for T, N, and M is 0.807, 0.767, 1.0 respectively. However, performance declined during the evaluation phase of the test sets, a drop from 0.938 to 0.858 of test set 1 to 2, for the Macro-F1 score across all stages; suggesting limitations in model generalizability, sensitivity to class imbalance, and challenges in processing lengthy clinical documents. Although this study provides an efficient baseline model and a reproducible pipeline, further optimization and validation are required before it can be considered suitable for use in a real-world clinical setting.
- Abstract(参考訳): 本研究は,SMM4H-HeaRD 2026の6番目の共有タスクとして癌ゲノムアトラス(TCGA)を報告し,腫瘍,リンパ節,転移(TNM)ステージラベルを独立に予測することを目的としている。
問題は3つのマルチラベル分類タスクとして構成されている。
本稿では,TF-IDF(Term Frequency-Inverse Document Frequency)機能を用いた古典的および深層学習のアプローチと,CeriorBERT,BioBERT,PubMedBERTの埋め込みについて検討する。
これらの表現は、 Logistic Regression (LR)、 Light Gradient Boosting Machine (LightGBM)、Feed-Forward Neural Networks (FFNN)、 Wide Residual Networks (WRN) で使用される。
以上の結果から,TNMラベルの分類と同様の埋め込みが可能である一方で,それらの組み合わせによって予測能力が向上することが示唆された。
WRNはトレーニングフェーズでそれぞれ0.839(T)、0.8502(N)、0.803(M)のAUROCスコアを0.622、0.702、0.9337とする。
TF-IDFのLightGBMはAUROCスコアが0.9368(T)、0.9524(N)、0.8311(M)、F1スコアが0.7559(T)、0.7384(N)、0.7017(M)で最高となる。
さらに、テストセットに対するCodabenchの結果は、テストセット1に対してそれぞれT、N、MのマクロF1スコアが0.978、0.957、0.879であり、テストセット2はT、N、MのマクロF1スコアが0.807、0.767、1.0であることを示す。
しかし, テストセットの評価段階では, マクロF1スコアの0.938から0.858に低下し, モデル一般化性, クラス不均衡に対する感受性, 長期臨床文書処理の課題が示唆された。
本研究は,効率的なベースラインモデルと再現可能なパイプラインを提供するが,実際の臨床現場での使用に適していると考えられるまでには,さらなる最適化と検証が必要である。
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