論文の概要: GigaPath-Flash and GigaTIME-Flash: Efficient Pathology Foundation Models for Whole-Slide and Tumor Microenvironment Analysis
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2607.18218v1
- Date: Mon, 20 Jul 2026 17:52:33 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-07-21 18:48:37.728882
- Title: GigaPath-Flash and GigaTIME-Flash: Efficient Pathology Foundation Models for Whole-Slide and Tumor Microenvironment Analysis
- Title(参考訳): GigaPath-FlashとGigaTIME-Flash:全スライディングおよび腫瘍微小環境解析のための効率的な病理基盤モデル
- Abstract要約: 基礎モデルでは、がんの診断、予後、治療の選択を変換することができる。
事前訓練されたほとんどのモデルは、画像タイルレベルでのみ動作し、制限付きライセンスを使用し、計算コストを抑える。
本稿では,GigaPathFlashとGigaTIME-Flashを紹介する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 40.67175174817272
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Foundation models have emerged as a driving force in computational pathology, with the potential to transform cancer diagnosis, prognosis, and treatment selection by learning transferable representations from large-scale histopathology data. A growing landscape of pathology foundation models now spans diverse data sources, architectures, and downstream applications. However, most pretrained models operate only at the image-tile level, use restrictive licenses, and remain computationally expensive, limiting large-scale slide-level clinical and research use. Here, we introduce GigaPath-Flash and GigaTIME-Flash, efficient models for whole-slide pathology AI and spatial proteomics prediction. GigaPath-Flash combines a 22M-parameter ViT-S tile encoder with a 21M-parameter LongNet slide encoder, both pretrained on large-scale real-world histopathology data. Its compact tile encoder is distilled from the billion-parameter GigaPath (ViT-g) teacher and shared by both models. GigaPath-Flash retains 97% of GigaPath's average slide-level performance with 50x less compute. GigaTIME-Flash extends this backbone to predict the tumor immune microenvironment directly from routine H&E images. It surpasses the original CNN-based GigaTIME in prediction quality while running 6x faster and using 8x less GPU memory. Together with GigaPath and GigaTIME, these models form an open-weight, Apache-2.0-licensed family pretrained on large-scale real-world clinical data. By releasing all models and weights, we provide accessible building blocks for computational pathology, immuno-oncology, and precision health.
- Abstract(参考訳): 基礎モデルは, 癌診断, 予後, 治療選択を, 大規模な病理組織学データから学習可能な表現を学習することによって変化させる可能性を持った, 計算病理学の原動力として現れてきた。
病理基盤モデルの展望は、様々なデータソース、アーキテクチャ、下流アプリケーションにまたがっている。
しかし、事前訓練されたほとんどのモデルは画像タイルレベルでのみ動作し、制限されたライセンスを使用し、計算コストがかかり、大規模なスライドレベルの臨床および研究の使用が制限される。
本稿では,GigaPath-FlashとGigaTIME-Flashを紹介する。
GigaPath-Flashは22MパラメータのViT-Sタイルエンコーダと21MパラメータのLongNetスライドエンコーダを組み合わせる。
小型のタイルエンコーダは10億パラメートルのギガパス(ViT-g)の教師から蒸留され、両方のモデルで共有される。
GigaPath-Flashは、GigaPathの平均スライドレベルのパフォーマンスの97%を保持しており、計算量は50倍少ない。
GigaTIME-Flashはこのバックボーンを拡張し、通常のH&E画像から直接腫瘍免疫マイクロ環境を予測する。
従来のCNNベースのGigaTIMEを6倍高速で8倍少ないGPUメモリを使用して予測品質で上回る。
GigaPathやGigaTIMEとともに、これらのモデルは、大規模な実世界の臨床データに基づいて事前訓練された、オープンウェイトでApache-2.0ライセンスのファミリーを形成する。
すべてのモデルと重みを解放することにより、計算病理学、免疫オンコロジー、精度の高い健康のためのアクセス可能なビルディングブロックを提供する。
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