論文の概要: Hypothesis-and-Refinement Learning of Organic Structures from Multimodal Spectroscopic Data
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2607.19816v1
- Date: Wed, 22 Jul 2026 06:50:53 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-07-23 18:51:37.995473
- Title: Hypothesis-and-Refinement Learning of Organic Structures from Multimodal Spectroscopic Data
- Title(参考訳): 多モード分光データによる有機構造の仮説と微細化学習
- Abstract要約: 我々は、スペクトル証拠を大規模分子前駆体と密に統合するスケーラブルな仮説修正パラダイムを開発する。
我々は、マルチモーダルスペクトル入力に条件付された化学的に有効な分子仮説を提案するスペクトル-構造モデルであるtextbfSpectroMol を紹介する。
また、分子式、正確な質量、不飽和度を統合した高分解能質量制約分子発生器であるtextbfMS-Mol2Mol を開発した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 41.531262858699925
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Determining molecular structures from spectroscopic data remains fundamentally challenging because the inverse problem is intrinsically underdetermined: individual spectra are sparse, low-dimensional, and encode only partial structural evidence relative to the vast space of possible molecules. We address this challenge by formulating automated structure elucidation as a scalable hypothesis-refinement paradigm that tightly integrates spectral evidence with large-scale molecular priors. To supply structure-resolving NMR signals for multimodal learning, we construct \textbf{QM9SPIN}, a DFT-derived dataset comprising diverse 1D and 2D spectra, including J-coupling, DEPT experiments, and explicit spin--spin interactions. On this foundation, we introduce \textbf{SpectroMol}, a spectrum-to-structure model that proposes chemically valid molecular hypotheses conditioned on multimodal spectral inputs. Complementarily, we develop \textbf{MS-Mol2Mol}, a high-resolution mass-constrained molecular generator that integrates molecular formula, exact mass, and degree of unsaturation within a conditional generative prior trained on 400 million molecules, ensuring global compositional consistency and chemically realistic refinement. The integrated system achieves 93.8\% top-1 accuracy on the simulated benchmark, adapts effectively from simulated to experimental spectra with limited experimental fine-tuning, and further improves experimental predictions through mass-guided refinement, establishing a scalable route toward automated, data-driven organic structure elucidation.
- Abstract(参考訳): 逆問題は本質的に過小評価されており、個々のスペクトルはスパースで低次元であり、考えられる分子の広大な空間に対する部分的な構造的証拠のみを符号化している。
この課題は、大規模分子前駆体とスペクトル証拠を密に統合するスケーラブルな仮説修正パラダイムとして、自動構造解明を定式化することによって解決される。
マルチモーダル学習のための構造分解型NMR信号の供給を目的として,J-カップリング,DEPT実験,明示的なスピンスピン相互作用を含む,多種多様な1Dおよび2DスペクトルからなるDFT由来のデータセットであるtextbf{QM9SPIN}を構築した。
本稿では,マルチモーダルスペクトル入力に条件付けされた化学的に有効な分子仮説を提案するスペクトル-構造モデルである \textbf{SpectroMol} を紹介する。
相補的に, 分子式, 正確な質量, 不飽和度を統合した高分解能な質量制約分子生成装置である \textbf{MS-Mol2Mol} を開発した。
この統合システムは、シミュレーションされたベンチマーク上で93.8\%のトップ-1精度を実現し、実験的な微調整でシミュレートされたスペクトルから実験的なスペクトルに効果的に適応し、さらに質量誘導精製による実験的予測を改善し、自動化されたデータ駆動の有機構造解明へのスケーラブルな経路を確立する。
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