論文の概要: On-Device Multi-Species Malaria Detection with Uncertainty-Calibrated Slide-Level Aggregation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2608.08566v1
- Date: Sun, 09 Aug 2026 08:09:25 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-08-11 19:16:36.870655
- Title: On-Device Multi-Species Malaria Detection with Uncertainty-Calibrated Slide-Level Aggregation
- Title(参考訳): 不確かさ校正スライドレベルアグリゲーションを用いたオンデバイス多種マラリア検出
- Abstract要約: マラリアは、専門家のマイクロスコピストが不足している資源制限設定において、依然として主要な死因である。
本研究は,医療センターが指定する重要な要件に対処するマラリア診断パイプラインを開発した。
本稿では,これらの臨床的制約を強調し,対処方法を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.1749935196721634
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Malaria remains a leading cause of mortality in resource-limited settings, where expert microscopists are scarce. Automated diagnosis based on microscopy images thus has strong potential to improve care delivery. But for an algorithm to deploy, a necessary requirement is that it meet a suite of non-obvious (from a machine learning (ML) perspective) clinical constraints. Therefore, in close consultation with a national health center we developed a malaria diagnosis pipeline which addresses key requirements listed by the health care center but typically ignored in the ML malaria literature. In particular, it includes: (i) stopping criteria (to reduce image acquisition and time-to-result); (ii) human-in-the-loop functionality (for review and accountability); (iii) multi-species discrimination (since treatment varies by species); (iv) thick film detection (standard for microscopy); (v) computationally-efficient uncertainty calculations (to aid clinician review); and (vi) an edge device platform (since internet can be spotty in this catchment area). The mobile system performs all inference on-device using YOLOv13n deployed via TensorFlow Lite. It detects four species and white blood cells from Giemsa-stained thick blood smear images, aggregating per-image detections into slide-level parasitemia with World Health Organization (WHO)-standard quantification. This paper highlights these various clinical constraints and offers methods to address them. Evaluated on 2,739 annotated images across all four species, the system achieves mAP@0.5 of 0.863, per-image parasite count correlation of r = 0.812, slide-level r = 0.951 (soft counting, 10 images/slide), and runs entirely offline with a pipeline time of 10.27 +- 1.65 s per image.
- Abstract(参考訳): マラリアは、専門家のマイクロスコピストが不足している資源制限設定において、依然として主要な死因である。
顕微鏡画像に基づく自動診断は、ケアデリバリーの改善に強い可能性を秘めている。
しかし、アルゴリズムがデプロイするために必要な要件は、(機械学習(ML)の観点から)望ましくない一連の臨床制約を満たすことである。
そこで我々は,全国保健センターとの緊密な協議で,医療センターが指定する重要な要件に対処するマラリア診断パイプラインを開発したが,一般的にはMLマラリア文献で無視される。
特に以下を含む。
一 基準(画像取得及び再送の時間を削減すること。)
(二 レビュー及び説明責任のための)ループ内機能
(三)多種差別(種によって扱いが異なります)
(四)厚膜検出(顕微鏡の標準)
五 計算効率のよい不確実性計算(臨床医の診察を支援するため)及び
(vi)エッジデバイスプラットフォーム(この捕獲エリアではインターネットが不明瞭である可能性がある)
モバイルシステムは、TensorFlow Lite経由でデプロイされたYOLOv13nを使用して、デバイス上ですべての推論を実行する。
世界保健機関(WHO)の標準的な定量化により、ギムサ染色された厚い血液スミア画像から4種の種と白血球を検出し、スライドレベルの寄生虫症に画像ごとの検出を集約する。
本稿では,これらの臨床的制約を強調し,対処方法を提案する。
このシステムは4種すべてにわたる2,739枚の注釈付き画像に基づいて評価され、r = 0.812、スライドレベル r = 0.951(ソフトカウント、10枚/スライディング)の画像当たりの寄生虫数相関である0.863のmAP@0.5を達成し、パイプライン時間10.27 +- 1.65秒で完全にオフラインで実行される。
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