論文の概要: Decomposing Whole Slide Image Report Generation with Graph-Constrained Multiple Instance Learning Workflows
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2608.15353v1
- Date: Sat, 15 Aug 2026 18:16:38 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-08-18 19:59:03.275117
- Title: Decomposing Whole Slide Image Report Generation with Graph-Constrained Multiple Instance Learning Workflows
- Title(参考訳): グラフ制約付き複数インスタンス学習ワークフローによる全スライド画像生成の分解
- Abstract要約: 凍結したVirchow2タイルの埋め込みをMIL(Multiple-instance Learning)分類ヘッドで集約するフレームワークを提案する。
臓器条件付きグラフは、これらの回答の集合を、言語モデルが病理報告として実現した構造化推論連鎖に制約する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.07817813851272346
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Whole-slide image (WSI) report generation requires recognizing spatially distributed pathological features and organizing them into a coherent diagnostic narrative. Although direct vision-to-text models can yield fluent reports, they obscure the contributions and failure modes of visual recognition, structured reasoning, and language generation. We propose a decomposed framework in which frozen Virchow2 tile embeddings are aggregated by multiple-instance learning (MIL) classification heads that answer organ-specific diagnostic questions. An organ-conditioned graph constrains the assembly of these answers into a structured reasoning chain, which a language model realizes as a pathology report. On the REG2026 held-out set of 2,028 slides, the proposed workflow achieved a chain-Jaccard score of 0.702. Performance fell to 0.420 without graph-based chain construction, 0.398 when the organ-specific graphs were replaced by a single organ-agnostic graph, and 0.371 when the language model constructed the chain freely from MIL predictions. Using the same report generator, graph-structured chains improved the report score from 0.330 to 0.495. On 350 external TCGA WSIs spanning the seven REG organs without fine-tuning, the expected organ graph was selected in 64.0% of cases and ranked among the top three in 86.6%. Providing the correct organ graph increased agreement with coarse TCGA primary-diagnosis labels from 61.8% to 92.6%, identifying organ routing as a main bottleneck under domain shift. Overall, organ-conditioned, graph-constrained chain assembly improves structured reasoning and report generation while enabling stage-specific error localization.
- Abstract(参考訳): 全スライディング画像(WSI)レポート生成には,空間的に分布する病理的特徴を認識し,それらをコヒーレントな診断物語として整理する必要がある。
直接視覚からテキストへのモデルでは、流動的なレポートが得られるが、視覚認識、構造化推論、言語生成のコントリビューションと失敗モードは曖昧である。
本稿では,凍結したVirchow2タイルの埋め込みを,臓器固有の診断問題に答えるMIL(Multiple-instance Learning)分類ヘッドによって集約する分解フレームワークを提案する。
臓器条件付きグラフは、これらの回答の集合を、言語モデルが病理報告として実現した構造化推論連鎖に制約する。
2,028枚のスライドからなるREG2026のホールトアウトセットにおいて、提案されたワークフローはチェーンジャカードスコア0.702を達成した。
性能はグラフベースの連鎖構築なしで0.420に低下し、臓器固有のグラフが単一の臓器に依存しないグラフに置き換えられた0.398、言語モデルがMIL予測から自由にチェーンを構築した0.371に低下した。
同じレポートジェネレータを使用して、グラフ構造チェーンはレポートスコアを0.330から0.495に改善した。
細調整なしで7つのREG臓器にまたがる350の外部TCGA WSIでは64.0%の症例で臓器グラフが選択され、86.6%で上位3位にランクされた。
適切な臓器グラフを提供することで、粗いTCGA原発診断ラベルとの一致が61.8%から92.6%に増加した。
全体として、組織条件付きグラフ制約チェーンアセンブリは、ステージ固有のエラーローカライゼーションを可能にしながら、構造化推論とレポート生成を改善している。
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