論文の概要: A General-Purpose Molecular Foundation Model Transfers Across Diverse Olfactory Tasks
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2608.25893v1
- Date: Wed, 26 Aug 2026 15:11:15 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-08-27 14:15:15.875763
- Title: A General-Purpose Molecular Foundation Model Transfers Across Diverse Olfactory Tasks
- Title(参考訳): 汎用分子基盤モデルによる多様な嗅覚課題間の伝達
- Authors: Yikun Han, Yi Wang, Neil Mankodi, Stephen Yang, Ambuj Tewari,
- Abstract要約: 本研究では,単一標準嗅覚予測タスクを微調整した分子基盤モデルを用いて,多種多様な機械の作用問題間で伝達される表現を学習できるかどうかを考察する。
GS-LFベンチマークのUni-Mol2を多ラベル匂い記述子予測のために微調整し、追加のディープラーニングトレーニングなしで結果モデルを評価する。
微調整されたモデルは、GS-LFベンチマークにおける最先端のウルフアクション固有のベースラインのパフォーマンスと一致し、これらの下流評価を一貫して転送する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 21.327527107800016
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Foundation models have transformed molecular property prediction, yet it remains unclear whether a molecular foundation model, fine-tuned on a single canonical olfactory prediction task, can learn representations that transfer across diverse machine olfaction problems. We investigate this question by fine-tuning Uni-Mol2 on the GS-LF benchmark for multi-label odor descriptor prediction and evaluating the resulting model, without additional deep-learning training, on four complementary downstream settings: cross-dataset odor descriptor prediction, odorous-versus-odorless classification, enantiomer evaluation, and odor mixture discriminability. The fine-tuned model matches or exceeds the performance of the state-of-the-art olfaction-specific baseline on the primary GS-LF benchmark and consistently transfers across these downstream evaluations. The enantiomer analysis further shows that three-dimensional molecular representations distinguish mirror-image molecules in a way that two-dimensional graph models fundamentally cannot, although accurately predicting the perceptual consequences of stereochemistry remains an open challenge. Together, these results support a train-once, transfer-across-tasks paradigm for machine olfaction and suggest that chemically pretrained molecular representations provide a strong foundation for transferable olfactory prediction.
- Abstract(参考訳): 基礎モデルは分子特性予測を変容させたが、単一の標準嗅覚予測タスクで微調整された分子基盤モデルが、多様な機械の嗅覚問題を伝達する表現を学習できるかどうかは不明である。
マルチラベルの匂い記述子予測のためのGS-LFベンチマークでUni-Mol2を微調整し,さらに深層学習訓練を行わずに,次の4つの相補的な下流設定(クロスデータセットの匂い記述子予測,臭気-無臭分類,エナンチオマー評価,臭気混合識別性)でモデルの評価を行った。
微調整されたモデルは、GS-LFベンチマークにおける最先端のウルフアクション固有のベースラインのパフォーマンスと一致し、これらの下流評価を一貫して転送する。
エナンチオマー分析により、立体化学の知覚結果を正確に予測しながらも、2次元グラフモデルが基本的に不可能な方法でミラー像分子を3次元分子表現が区別できることが示される。
これらの結果は共に、機械の嗅覚に対するトレイン・オンス・トランスファー・アクロス・タスクのパラダイムを支持し、化学的に事前訓練された分子表現が転写可能な嗅覚予測の強力な基盤となることを示唆している。
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