論文の概要: Subtraction-Based Tumor Segmentation and Lesion-Centered pCR Prediction for the MAMA-MIA Challenge
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2608.29162v1
- Date: Sat, 29 Aug 2026 09:23:45 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-09-01 18:31:30.863649
- Title: Subtraction-Based Tumor Segmentation and Lesion-Centered pCR Prediction for the MAMA-MIA Challenge
- Title(参考訳): MAMA-MIAチャレンジにおけるサブトラクションベース腫瘍分節と病変中心pCR予測
- Abstract要約: 我々は,MAMA-MIAチャレンジへのチームFMEの提出について述べる。
原発性腫瘍の分節と病理学的完全反応の予測について検討した。
FMEは両部門で2位となった。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: We describe the submission of team FME to the MAMA-MIA Challenge, which evaluated primary tumor segmentation and prediction of pathological complete response (pCR) from pretreatment dynamic contrast-enhanced breast MRI on an external multi-country cohort. For segmentation, we trained a five-fold residual-encoder nnU-Net ensemble using only the first post-contrast minus pre-contrast image, combined with mirroring test-time augmentation and largest-connected-component filtering. For pCR prediction, we ensembled 25 pretrained 3D video classifiers trained on lesion-centred crops from the pre-contrast and first two post-contrast volumes. FME ranked second in both tasks. The segmentation method achieved a combined performance-fairness score of 0.882, with Dice 0.713 and normalized Hausdorff distance 0.099. The pCR method achieved a combined score of 0.664, balanced accuracy of 0.541, and equalized-odds disparity of 0.212. The results indicate that subtraction-based input and ensembling support robust tumor segmentation under cross-site domain shift, whereas pCR prediction from baseline DCE-MRI alone remains limited. For the submission repository, see https://github.com/FraunhoferMEVIS/MAMA-MIA-Challenge-FME
- Abstract(参考訳): 胸部MRIを外用した多国間コホートを用いた術前ダイナミックコントラスト強調画像から,原発性腫瘍の分画と病理学的完全反応(pCR)の予測を評価したMAMA-MIA ChallengeへのチームFMEの提出について述べる。
セグメンテーションのために,第1コントラスト前コントラスト画像のみを用いて5倍残留エンコーダnnU-Netアンサンブルを訓練し,ミラーリング試験時間拡張と最大接続成分フィルタリングを併用した。
pCR予測では,前コントラストの病変中心の作物を訓練した25の事前訓練された3Dビデオ分類器と,最初の2つのコントラスト後ボリュームをアンサンブルした。
FMEは両部門で2位となった。
セグメンテーション法は、Dice 0.713 と正規化された Hausdorff 距離 0.099 で、パフォーマンス・フェアネススコア 0.882 を達成した。
pCR法は0.664, 平衡精度0.541, 等化オードの相違0.212を得た。
その結果、サブトラクションベースの入力とアンサンブルは、クロスサイトドメインシフト下で頑健な腫瘍セグメンテーションをサポートするが、ベースラインDCE-MRIのみからのpCR予測は限定的であることが示された。
提出リポジトリについては、https://github.com/FraunhoferMEVIS/MAMA-MIA-Challenge-FMEを参照してください。
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