論文の概要: PiPMRE: A Pipeline Based on Language Model for Medical Relation Extraction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2609.02896v1
- Date: Fri, 03 Jul 2026 02:27:09 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-09-28 05:09:55.45054
- Title: PiPMRE: A Pipeline Based on Language Model for Medical Relation Extraction
- Title(参考訳): PiPMRE:医療関係抽出のための言語モデルに基づくパイプライン
- Abstract要約: 医用関係抽出(MRE)は、医用テキストからエンティティとそれらの関係を共同で抽出することで一般的に知られている。
従来の研究では、MREをシーケンスタギングタスクとして扱い、タグ付けスキーマの難しい設計や複数の関係の抽出に失敗する結果となった。
我々は,MRE性能を向上させるために,言語モデルに基づく新しいパイプラインフレームワークであるPiPMREを開発した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 13.089899833026216
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Medical relation extraction (MRE) is commonly known for extracting entities and their relations jointly from a medical text, which has attracted considerable attention in recent years. Previous studies treat MRE as a sequence tagging task, which results in either a challenging design of the tagging schema or a failed extraction of multiple relations, due to intricate relationships among medical entities. In this work, we review the task from the linguistic perspective and propose a novel pipeline framework, PiPMRE, developed on language models to enhance MRE performance. Specifically, PiPMRE consists of a relation generator and a relation filter. Given a text, the generator first yields multiple relational triplets, and then the filter scores each triplet and retains only those that pass the borderline as the final results. Implementing PiPMRE requires no tagging schema; instead, we use a simple template to reformulate the input text, ensuring that entities and relations are generated in a contextual order. Extensive experimental results on two public datasets demonstrate the advancement of PiPMRE. It surpasses the previous state-of-the-art by an average of 5.6 recall points and 4.4 accuracy points. PiPMRE's superiority is also demonstrated in few-shot settings.
- Abstract(参考訳): 医用関係抽出(MRE)は,近年注目されている医療用テキストからエンティティとそれらの関係を共同で抽出することが一般的である。
従来の研究では、MREをシーケンスタギングタスクとして扱うことで、タグ付けスキーマの困難な設計や、医療機関間の複雑な関係のため、複数の関係の抽出に失敗する可能性がある。
本稿では,言語の観点からタスクをレビューし,MRE性能を向上させるために言語モデル上で開発された新しいパイプラインフレームワークであるPiPMREを提案する。
具体的には、PiPMREは関係生成器と関係フィルタから構成される。
テキストが与えられた後、ジェネレータはまず複数のリレーショナル三重項を生成し、次にフィルタは各三重項をスコアし、境界線を通過するもののみを最終結果として保持する。
代わりに、簡単なテンプレートを使って入力テキストを再構成し、エンティティとリレーションがコンテキスト順に生成されることを保証します。
2つの公開データセットの大規模な実験結果は、PiPMREの進歩を示している。
平均5.6のリコールポイントと4.4の精度ポイントで、過去の最先端技術を上回っている。
PiPMREの優位性も、数ショット設定で示される。
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