論文の概要: Embedded Graph Flows for Categorical Graph Generation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2609.05328v1
- Date: Fri, 04 Sep 2026 16:26:41 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-09-07 18:15:24.116314
- Title: Embedded Graph Flows for Categorical Graph Generation
- Title(参考訳): カテゴリグラフ生成のための埋め込みグラフフロー
- Abstract要約: ノードおよび非順序エッジカテゴリに対する連続的な埋め込みを学習する生成モデルを提案する。
端末読み出しは、埋め込みを個別のグラフカテゴリにマップする。
分子ベンチマーク全体では、EGFは競合性能を達成した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 16.10813350475306
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Generating categorical graphs requires choosing node and edge types that form a coherent structure without depending on node order. Many graph generators encode categories as fixed one-hot vectors, which can impose an artificial geometry in which categories are equidistant. We propose Embedded Graph Flows (EGF), a generative model that learns continuous embeddings for node and unordered-edge categories and transports Gaussian noise towards these learnt endpoints using a permutation-equivariant graph transformer. A terminal readout maps the embeddings back to discrete graph categories. Across molecular benchmarks, EGF achieved competitive performance. On QM9, EGF gives the best result on all four reported metrics among the three methods, including a Fréchet ChemNet Distance (FCD) of 0.150, compared with 0.717 for the categorical-diffusion baseline DiGress and 0.812 for the bridge-based baseline GruM. When applied to larger molecules in ZINC250k, EGF retains the lowest maximum mean discrepancy (MMD) using the neighbourhood subgraph pairwise distance kernel (NSPDK), indicating close agreement with the local substructures of the reference molecules. Our code is available at https://github.com/Trusted-System-Lab/EGF.
- Abstract(参考訳): 分類グラフを生成するには、ノード順序に依存することなくコヒーレントな構造を形成するノードタイプとエッジタイプを選択する必要がある。
多くのグラフ生成器は、カテゴリを固定された1ホットベクトルとしてエンコードし、カテゴリが等距離である人工幾何学を課すことができる。
本研究では,ノードおよび非順序エッジカテゴリの連続埋め込みを学習し,置換同変グラフ変換器を用いてガウスノイズをこれらの学習終端へ輸送する生成モデルEGFを提案する。
端末読み出しは、埋め込みを個別のグラフカテゴリにマップする。
分子ベンチマーク全体では、EGFは競合性能を達成した。
QM9では、EFFはFréchet ChemNet Distance (FCD) の0.150の3つの手法の中で、カテゴリー拡散ベースラインのDiGressでは0.717、ブリッジベースベースラインのGruMでは0.812の4つの指標で最高の結果を与える。
ZINC250kのより大きな分子に適用すると、EGFは、近隣のサブグラフ対距離核 (NSPDK) を用いて、基準分子の局所的な部分構造との密接な一致を示す最小の最大平均誤差(MMD)を保持する。
私たちのコードはhttps://github.com/Trusted-System-Lab/EGFで利用可能です。
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