論文の概要: A Learning Algorithm for Threshold Boolean Networks with Prescribed Fixed Points
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2609.20298v1
- Date: Tue, 18 Aug 2026 00:28:07 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-09-21 16:32:15.687539
- Title: A Learning Algorithm for Threshold Boolean Networks with Prescribed Fixed Points
- Title(参考訳): 既定固定点を有する閾値ブールネットワークの学習アルゴリズム
- Abstract要約: 本稿では,しきい値ブールネットワーク(TBN)を所定の定点集合で推定する学習アルゴリズムを提案する。
提案手法では, 固定点保存を共同で実施し, 突発的引き金のペナルティ化, バイナリ出力の促進, およびL1正則化による空間性向上を行う。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.5229257192293202
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: We present a learning algorithm for inferring threshold Boolean networks (TBNs) with a prescribed set of fixed points. The proposed method employs a custom differentiable loss function that jointly enforces fixed point preservation, penalizes spurious attractors, encourages binary outputs, and promotes sparsity through L1 regularization. Applied to the FOS-GRN model of Arabidopsis thaliana, the approach achieved perfect reconstruction (i.e., all 10 desired fixed points and no spurious ones) in 5 out of 30 independent runs, recovering on average 8.53 $\pm$ 0.90 correct fixed points with no spurious attractors. In contrast, standard methods such as the Perceptron and Logistic Regression recovered up to 10 fixed points but introduced between 8 and 31 spurious ones. An additional analysis varying the sparsity coefficient ($λ$) confirmed that the method's performance and the structural properties of the inferred networks remain robust within a practical range (up to 0.01) of regularization strengths. Overall, the results demonstrate the effectiveness and stability of the proposed algorithm in capturing meaningful network dynamics under prescribed dynamical constraints.
- Abstract(参考訳): 本稿では,しきい値ブールネットワーク(TBN)を所定の定点集合で推定する学習アルゴリズムを提案する。
提案手法では, 固定点保存を共同で実施し, 突発的引き金のペナルティ化, バイナリ出力の促進, およびL1正則化による空間性向上を行う。
アラビドプシス・タリアナのFOS-GRNモデルに適用されたこの手法は、30回の独立ラン中5回の完全復元(すなわち、すべての所望の固定点と突発的な固定点)を達成し、平均8.53$\pm$ 0.90の正定点を回復した。
対照的に、パーセプトロンやロジスティック・レグレッションのような標準的な手法は、最大で10点まで回復したが、8点から31点の間に導入された。
余剰係数 (λ$) を変化させたさらなる分析により、この手法の性能と推定されたネットワークの構造特性が、正規化強度の実用範囲(最大0.01)内で頑健であることが確認された。
全体として,提案アルゴリズムの有効性と安定性は,所定の動的制約の下で有意なネットワークダイナミクスを捉える上で有効であることを示す。
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