論文の概要: Comparison of techniques for fine-tuning open-weight models for entity extraction from radiology reports
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2609.40236v1
- Date: Wed, 30 Sep 2026 17:32:17 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-10-01 18:57:28.18474
- Title: Comparison of techniques for fine-tuning open-weight models for entity extraction from radiology reports
- Title(参考訳): 放射線学報告からの実体抽出のための微調整オープンウェイトモデルの比較
- Abstract要約: 微調整と推論は、1台の24GBの消費者向けGPUのメモリエンベロープに適合する。
狭い、高価値な臨床ラベル抽出タスクでは、合成ラベルを生成するのではなく、実際のレポートを蒸留することが、ホストされたモデルとのギャップを埋める。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 11.027618503906984
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Converting free-text radiology reports into structured labels supports cohort building, quality assurance, and monitoring of clinical imaging models, but the strongest label extractors are hosted proprietary models whose use raises privacy, cost, and reproducibility concerns. We asked whether a fine-tuned open-weight model (Gemma-3-12B) can match GPT-4o at multi-label intracranial hemorrhage (ICH) acuity extraction from non-contrast head-CT reports, and which ingredients matter. Using a 2x2 design, we crossed two adaptation strategies (a discriminative classification head, CH; generative instruction fine-tuning, IFT) with two training-data sources (distillation of real GPT-4o-labeled reports; synthetic reports generated by GPT-4o from real exemplars), across five training sizes, benchmarked on 100 expert-adjudicated reports against GPT-4o and the un-tuned open-weight base. The distilled instruction-tuned model (DIFT) matched GPT-4o (macro-F1 0.845 vs 0.850; p = 1.000) and exceeded the base model by 0.178. The decisive factor was the training-data source, not the fine-tuning method: both synthetic-data models failed to exceed the un-tuned open-weight base at any training size and underperformed the distilled models across all acuity classes. Fine-tuning and inference fit within the memory envelope of a single 24 GB consumer GPU. For narrow, high-value clinical label-extraction tasks, distilling real reports, rather than generating synthetic ones, is what closes the gap to a hosted model, enabling a private, low-cost, version-stable on-premises alternative.
- Abstract(参考訳): 自由テキストラジオグラフィーレポートを構造化ラベルに変換することで、コホートビルディング、品質保証、臨床画像モデルのモニタリングをサポートするが、もっとも強力なラベル抽出者は、プライバシ、コスト、再現性に関する懸念を高めるプロプライエタリなモデルをホストしている。
頭蓋内出血 (ICH) におけるGPT-4oとGPT-4oとの適合性について検討した。
2x2設計を用いて,2つのトレーニングデータソース(実GPT-4oラベルレポートの蒸留,実例からGPT-4oが生成した合成レポート)を5つのトレーニングサイズで比較し,GPT-4oと未修正オープンウェイトベースに対する100のエキスパート適応レポートにベンチマークした。
蒸留命令調整モデル(DIFT)はGPT-4o(macro-F1 0.845 vs 0.850; p = 1.000)と一致し、ベースモデルよりも0.178以上であった。
両方の合成データモデルは、任意のトレーニングサイズで未調整のオープンウェイトベースを超えず、すべてのアクティクラスで蒸留されたモデルを過小評価した。
微調整と推論は、1台の24GBの消費者向けGPUのメモリエンベロープに適合する。
狭い、高価値な臨床ラベル抽出タスクでは、合成ラベルを生成するのではなく、実際のレポートを蒸留することが、ホストされたモデルとのギャップを埋め、プライベートで低コストでバージョン安定なオンプレミス代替手段を可能にする。
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