論文の概要: Multimodal reasoning for broadly neutralizing antibody discovery from label-free human B cell repertoires across virus families
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2610.03160v1
- Date: Fri, 02 Oct 2026 11:35:34 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-10-06 00:14:30.350224
- Title: Multimodal reasoning for broadly neutralizing antibody discovery from label-free human B cell repertoires across virus families
- Title(参考訳): ラベルのないヒトB細胞レパートリーからウイルスファミリーに分布する広範囲に中和する抗体発見のマルチモーダル推論
- Abstract要約: ImmuneAgentは、マルチモーダル推論と連続的なメタ学習とウェットラブフィードバックを統合するクローズドループAIシステムである。
このシステムは、55%の中和抗体発見率と11%のbnAb収率を達成する。
5種類の免疫抗原抗体は、臨床段階のMEDI8852に匹敵する致死的障害に対して100%in vivoで保護された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 13.013551874292228
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Discovering broadly neutralizing antibodies (bnAbs) from human natural immune repertoires remains a fundamental challenge in immunology, hindered by: the extreme rarity of bnAb, incomplete understanding of their cellular origins across pathogens, and the inability of existing computational tools to generalize across emerging viral threats. Here we present ImmuneAgent, a closed-loop AI system that integrates multimodal reasoning with continual meta-learning and wet-lab feedback to overcome these barriers. Applied to screen the natural BCR repertoires from vaccinated or infected cohorts, the system achieves a ~55% neutralization antibody discovery rate (60 of 110 cloned candidates) and a ~11% bnAb yield (12 of 110), substantially outperforming a state-of-the-art sequence-based neutralization predictor or cofolding models evaluated at the same cloning budget. Five ImmuneAgent-discovered antibodies conferred 100% in vivo protection against lethal influenza challenge, comparable to the clinical-stage therapeutic MEDI8852. The system recovered the cellular and structural determinants of bnAb activity and identified FCRL5+CD27+ atypical memory B cells as a conserved bnAb reservoir and hydrophobic interface enrichment as a cross-viral structural signature, which generalized to unseen antigens, discovering human metapneumovirus (hMPV) cross-neutralizing and human papillomavirus (HPV)-neutralizing antibodies without antigen-specific sorting. These results validate that ImmuneAgent is a generalizable framework for rapid therapeutic antibody discovery against emerging viral threats.
- Abstract(参考訳): ヒトの自然免疫レパートリーから広範囲に中和する抗体(bnAb)を発見できることは、免疫学の基本的な課題であり、bnAbの極度な希少性、病原体間の細胞起源の不完全な理解、既存の計算ツールが新たに出現するウイルスの脅威にまたがって一般化できないことなどによって妨げられている。
ここでは、マルチモーダル推論と連続メタ学習とウェットラブフィードバックを統合し、これらの障壁を克服するクローズドループAIシステムImmuneAgentを紹介する。
ワクチン接種または感染したコホートから天然のBCRレパートリーをスクリーニングするために、システムは、約55%の中和抗体発見率(110のクローン候補のうち60)と約11%のbnAb収率(110の12)を達成する。
5種類の免疫抗原抗体は、臨床段階のMEDI8852に匹敵する致死性インフルエンザに対する生体防御を100%付与した。
このシステムは、bnAb活性の細胞および構造決定因子を回収し、FCRL5+CD27+非定型記憶B細胞を保存されたbnAb貯水池として同定し、疎水性界面の富化をクロスウイルス構造シグネチャとして一般化し、ヒトメタニューモウイルス(hMPV)のクロスニュートラル化とヒトパピローマウイルス(HPV)のニュートラル化抗体を抗原特異的に選別せずに発見した。
これらの結果はImmuneAgentがウイルス感染の脅威に対する迅速治療抗体発見の一般的な枠組みであることを証明している。
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