論文の概要: Comprehensive Evaluation and Fine-Tuning of Foundational Cell Nuclei Segmentation Models in Renal Pathology
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2610.07711v1
- Date: Tue, 06 Oct 2026 04:05:49 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-10-08 02:58:29.793534
- Title: Comprehensive Evaluation and Fine-Tuning of Foundational Cell Nuclei Segmentation Models in Renal Pathology
- Title(参考訳): 腎疾患における基礎細胞核分節モデルの包括的評価と微調整
- Abstract要約: 汎用モデルは、しばしば低コントラスト、高密度核、複雑な形態、強い背景染色に苦しむ。
我々は,5,901のファンデーションモデル生成擬似ラベルを組み合わせることで,ループ内のヒューマン・イン・ザ・ループ・フレームワークを拡張した。
微調整によって全てのモデルが改善され、Mediumデータは9つの最高のパフォーマンス戦略のうち7つに含まれている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.955475151530131
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Accurate nuclei instance segmentation is essential for quantitative renal pathology, yet general-purpose models often struggle with low contrast, dense nuclei, complex morphology, and strong background staining. In this work, we extended a human-in-the-loop framework by combining 5,901 foundation-model-generated pseudo-labels from well-segmented cases (Easy), 860 newly expert-annotated unresolved challenging cases (Medium), and 198 expert-annotated consensus failure cases (Hard). These annotations, spanning different levels of segmentation difficulty, enabled the systematic evaluation of seven single-source and mixed-source fine-tuning strategies across nine cell segmentation model configurations. Fine-tuning improved all models, with Medium data included in seven of the nine best-performing strategies. LSP-DETR achieved the highest F1 score of 0.8725 with Hard-only fine-tuning, while StarDist showed the largest improvement, increasing from 0.7380 to 0.8332 with Medium-only fine-tuning. These findings show that annotations spanning multiple difficulty levels support effective model adaptation, although the optimal annotation composition remains model dependent.
- Abstract(参考訳): 正確な核のインスタンス・セグメンテーションは定量的腎病理学に必須であるが、汎用モデルは低コントラスト、高密度核、複雑な形態、強い背景染色に苦しむことが多い。
本研究では,5,901のファンデーションモデル生成擬似ラベルを,よく分類されたケース (Easy), 860の新たな専門家による未解決問題 (Medium), 198の専門家によるコンセンサス障害 (Hard) から組み合わせて,ループ型フレームワークを拡張した。
これらのアノテーションは、セグメンテーションの難易度が異なるため、9つのセルセグメンテーションモデル構成にまたがる7つの単一ソースおよび混合ソースの微調整戦略の体系的評価を可能にした。
微調整によって全てのモデルが改善され、Mediumデータは9つの最高のパフォーマンス戦略のうち7つに含まれている。
LSP-DETRはハードのみの微調整で0.8725点、スターディストは0.7380点から0.8332点に増加し、ミディアムのみの微調整で0.8725点を記録した。
これらの結果から,複数の難易度にまたがるアノテーションは効果的なモデル適応を支援するが,最適なアノテーション構成はモデル依存のままであることがわかった。
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