論文の概要: Beyond Fixed Acquisition Functions: Temporal Difference Active Learning for Perturbation Discovery
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2610.22122v1
- Date: Thu, 15 Oct 2026 16:00:11 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-10-17 06:09:33.181184
- Title: Beyond Fixed Acquisition Functions: Temporal Difference Active Learning for Perturbation Discovery
- Title(参考訳): 固定獲得関数を超える:摂動探索のための時間差アクティブ学習
- Abstract要約: 時間差アクティブラーニング(TDAL)は,1つのスクリーニング軌道から時間差学習を通じて,オンラインの取得関数を学習する。
実験的な構成の異なるシングル、ダブル、トリプルの摂動にまたがる8つのパブリックスクリーンで、TDALは11の手法の中で平均1.63のランクを達成している。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.119400371617871
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Genetic and drug perturbation screens are important tools for elucidating disease mechanisms and validating therapeutic targets, but experimental costs limit the number of candidates that can be tested. Existing perturbation screening methods typically update the surrogate model with feedback while keeping the acquisition function fixed, limiting their ability to adapt selection to different response landscapes. Experimental feedback reveals current hits and informs subsequent selection by updating candidate predictions, providing a training signal for learning how to select experiments. We formulate budgeted perturbation discovery as a sequential decision problem and propose Temporal Difference Active Learning (TDAL), which learns an acquisition function online through temporal difference learning from a single screening trajectory, accounting for current hits and future discoveries. TDAL uses the Hellinger distance between hit probabilities for unmeasured candidates before and after an experiment to weight successor value, and reuses measured outcomes through leave-batch-out (LBO) to construct virtual transitions and alleviate training data scarcity. Across eight public screens spanning single, double, and triple perturbations under varied experimental configurations, TDAL achieves an average rank of 1.63 among eleven methods and ranks first on four tasks, demonstrating its adaptability across response landscapes.
- Abstract(参考訳): 遺伝子および薬物の摂動スクリーンは、疾患のメカニズムを解明し、治療対象を検証するための重要なツールであるが、実験コストは検査可能な候補の数を制限している。
既存の摂動スクリーニング手法は、通常、サロゲートモデルをフィードバックで更新し、取得関数を固定し、異なる応答ランドスケープに選択を適用する能力を制限する。
実験的なフィードバックは、現在のヒットを明らかにし、候補予測を更新することで、その後の選択を通知し、実験の選択方法を学ぶためのトレーニング信号を提供する。
本稿では,摂動探索を逐次決定問題として定式化し,時間差アクティブラーニング(TDAL)を提案する。
TDALは、実験前後の未測定候補に対するヒット確率間のHellinger距離を用いて、後続値の重み付けを行い、仮想遷移を構築し、トレーニングデータの不足を軽減するために、離脱バッチアウト(LBO)を通じて測定結果の再利用を行う。
実験的な構成で、シングル、ダブル、トリプルの摂動にまたがる8つのパブリックスクリーンの中で、TDALは11のメソッドの中で平均1.63のランクを達成し、4つのタスクで1位を獲得し、応答のランドスケープ全体への適応性を実証した。
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