論文の概要: TAN: A Size- and Form-Adaptive Masked-Convolution Encoder for Tissue Graphs
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2610.23475v1
- Date: Fri, 16 Oct 2026 13:53:08 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-10-20 00:56:07.944509
- Title: TAN: A Size- and Form-Adaptive Masked-Convolution Encoder for Tissue Graphs
- Title(参考訳): TAN: 組織グラフのためのサイズおよび形状適応型マスケッド変換エンコーダ
- Abstract要約: スーパーピクセルを埋め込むために、現在のエンコーダはそれらをバウンディングボックスに収穫し、パッド、サイズ変更、あるいはマスクする。
TANはコンパクトな畳み込みエンコーダで、各スーパーピクセルをそのネイティブな形状と範囲で処理し、すべての操作から背景を除外する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Tissue graphs represent histology images as graphs over tissue-conforming superpixels, which keeps homogeneous tissue regions intact instead of cutting them into rectangular patches. To embed superpixels, current encoders crop them to bounding boxes and then pad, resize, or mask them, so background or fill values can leak into the node features. This matters in practice, and especially in medical imaging, where a prediction should depend on the tissue and not on an arbitrary preprocessing choice: on BACH, changing only the fill of the masked region shifts the accuracy of frozen encoders by up to 6 percentage points, larger than the differences among the four best encoders under mean fill, and the preferred fill differs between datasets, so it cannot be fixed once and for all. We present TAN (Tissue-Aware Network), a compact convolutional encoder (0.41M parameters) that processes each superpixel at its native shape and extent and excludes background from every operation, which makes its embeddings exactly invariant to the fill by construction. Under identical masks and an identical graph classifier, TAN's accuracy on BACH is not significantly different from that of the 303M-parameter foundation model UNI (81.1% vs. 80.7-82.6%, depending on the fill), with ~740x fewer parameters, ~1,190x fewer FLOPs, and no pretraining. On BRACS, TAN is close to a ResNet18 trained under the same protocol and trails the histopathology foundation models. An ablation with TAN's architecture but standard processing of fill-padded crops shows that masking keeps accuracy similar (nominally higher on BACH, lower on BRACS, within noise) at less than half the FLOPs.
- Abstract(参考訳): 組織グラフは組織像を組織形成スーパーピクセル上のグラフとして表現し、長方形のパッチに切るのではなく、均一な組織領域を無傷で保持する。
スーパーピクセルを埋め込むために、現在のエンコーダはそれらをバウンディングボックスに収穫し、パッド、サイズ変更、あるいはマスクする。
BACHでは、マスクされた領域の充填だけを変更すれば、凍結したエンコーダの精度が最大6ポイントずれ、平均充填下の4つのベストエンコーダの差よりも大きくなり、好みの充填はデータセットによって異なるため、一度でも修正できない。
本稿では,コンパクトな畳み込みエンコーダ(0.41Mパラメータ)であるTAN(T Issue-Aware Network)について述べる。
同一のマスクと同一のグラフ分類器の下では、TANのBACHの精度は、303Mパラメータの基礎モデルであるUNI(81.1%対80.7-82.6%)と大きく異なるものではなく、パラメータは740倍、FLOPは1,190倍、事前訓練はない。
BRACSでは、TANは同じプロトコルでトレーニングされたResNet18に近い。
TANのアーキテクチャと相関するが、充填された作物の標準的な処理は、マスクがFLOPの半分未満の精度で精度(BACH、BRACS、雑音下ではBRACS)を保っていることを示している。
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