論文の概要: Comparative Strategies for Handling Imbalanced QSAR Regression: A Case Study on hERG Activity Prediction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2611.01709v1
- Date: Sun, 01 Nov 2026 08:53:54 GMT
- ステータス: 情報取得中
- システム内更新日: 2026-11-03 20:17:08.394954
- Title: Comparative Strategies for Handling Imbalanced QSAR Regression: A Case Study on hERG Activity Prediction
- Title(参考訳): 不均衡QSAR回帰処理のための比較戦略:hERG活性予測のケーススタディ
- Abstract要約: データ不均衡はQSARモデリングで頻繁に発生する。
データのどの領域が疎密であるかを決定するのは難しい。
データレベルとアルゴリズムレベルの不均衡処理戦略は、モデルのパフォーマンスに異なる影響を与える可能性がある。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
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- Abstract: Data imbalance frequently occurs in QSAR modeling, yet most studies focus on classification tasks, and few address regression tasks, as it is challenging to determine which regions of the data are sparse or dense. Data-level and algorithm-level imbalance-handling strategies can have different effects on model performance. In this study, we systematically compare various strategies across GCN and fingerprint-based machine learning models. To evaluate model performance more meaningfully, we partitioned the target region into several subregions based on both domain knowledge and data distribution. We focused on the region of greatest practical interest. Our results demonstrate that selecting models based on this interest-region metric leads to more reliable performance than using the total region metric. We also observed that different imbalance-handling strategies can have divergent effects depending on the model type. These findings highlight the importance of region-aware evaluation in regression QSAR modeling and provide practical guidance for selecting appropriate strategies for imbalanced datasets.
- Abstract(参考訳): データ不均衡はQSARモデリングにおいて頻繁に発生するが、ほとんどの研究は分類タスクに焦点をあてており、データのどの領域が疎密であるかを判断することが難しいため、回帰タスクに対処することはほとんどない。
データレベルとアルゴリズムレベルの不均衡処理戦略は、モデルのパフォーマンスに異なる影響を与える可能性がある。
本研究では,GCNおよび指紋に基づく機械学習モデル間の様々な戦略を体系的に比較する。
モデルの性能をより有意に評価するために、対象領域をドメイン知識とデータ分布の両方に基づいて複数のサブリージョンに分割した。
私たちは最も実践的な関心のある地域に焦点を当てた。
本結果から,この関心領域メトリックに基づくモデル選択が,全領域メトリックよりも信頼性の高い性能をもたらすことが示された。
また, モデルの種類によって, 異なる不均衡処理戦略が相違する可能性があることも見いだした。
これらの結果は、回帰QSARモデリングにおける領域認識評価の重要性を強調し、不均衡なデータセットに対する適切な戦略を選択するための実践的なガイダンスを提供する。
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