論文の概要: OpenBrain: An Auditable Generated-Label Release for Whole-Brain MRI Parcellation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2611.05348v1
- Date: Tue, 03 Nov 2026 18:47:53 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-11-07 05:47:11.692184
- Title: OpenBrain: An Auditable Generated-Label Release for Whole-Brain MRI Parcellation
- Title(参考訳): OpenBrain:全脳MRIパーセレーションのための監査可能な生成ラベルリリース
- Abstract要約: OpenBrainは、607ソースデータセットから証明されたOpenNeuro T1wケースの信頼性を意識したリリースである。
OpenBrainは、スタンドアロンのセグメンテーションファイルのディレクトリではなく、監査可能なケースレコードリリースとして構成されている。
QC-7は、ラベル幾何学、画像ラベルの整合性、委員会の不一致に対する基準のない信頼性パネルである。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 11.591101573110953
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Automatic tools can now generate whole-brain MRI parcellations at cohort scale, but generated-label releases often provide little evidence about which cases are reliable enough to reuse. We introduce OpenBrain, a confidence-aware release of 35,838 provenance-verified OpenNeuro T1w cases from 607 source datasets. OpenBrain is organized as an auditable case-record release rather than a directory of standalone segmentation files: each record links a primary parcellation, two committee parcellations, source/license provenance, raw QC-7 measurements, percentile risks, a combined risk score R, and a confidence tier. QC-7 is a reference-free reliability panel over label geometry, image-label consistency, and committee disagreement, so users can filter, weight, audit, or re-threshold generated labels without rerunning inference. We evaluate this released evidence under a frozen protocol. Across external cohorts, lower QC-7 risk corresponds to higher generated-label quality; in fixed-budget training, lower-risk selections improve paired macro Dice over random selection by +3.2 to +3.7 percentage points. OpenBrain also exposes raw axes, committee outputs, provenance, and datasheet documentation, so confidence claims remain inspectable after download. It does not turn generated labels into manual annotations or clinical-grade segmentations. Its contribution is a large open generated-parcellation substrate, a reusable case-level risk-evidence layer, and an external validation protocol for release-time QC. Dataset: https://huggingface.co/datasets/lanqz7766/OpenBrain. Code: https://github.com/lanqz7766/openbrain.
- Abstract(参考訳): 自動ツールは、コホートスケールで全脳MRIパーセレーションを生成することができるが、生成されたラベルリリースは、どのケースが再利用に十分な信頼性を持つかという証拠をほとんど示さないことが多い。
我々は、607ソースデータセットから35,838の証明済みのOpenNeuro T1wケースの信頼性を意識したリリースであるOpenBrainを紹介します。
OpenBrainは、独立したセグメンテーションファイルのディレクトリではなく、監査可能なケースレコードリリースとして構成されている。各レコードは、プライマリパーセレーション、2つの委員会パーセレーション、ソース/ライセンスの証明、生のQC-7測定、パーセンタイルリスク、複合リスクスコアR、信頼層をリンクする。
QC-7は、ラベルの幾何、画像ラベルの整合性、委員会の不一致に対する基準のない信頼性パネルであり、ユーザーは推論を再実行することなく、生成されたラベルをフィルタリング、重み付け、監査、再保持することができる。
我々は、凍結されたプロトコルの下で、この放出された証拠を評価する。
固定予算トレーニングでは、低いリスク選択はランダム選択よりも+3.2から+3.7の比率でペアマクロダイスを改善する。
OpenBrainは生のx、委員会出力、証明、データシートのドキュメンテーションも公開している。
生成されたラベルを手動のアノテーションや臨床グレードのセグメンテーションに変えることはない。
コントリビューションは、大きなオープンなパーセレーション基板、再利用可能なケースレベルのリスクエビデンス層、リリース時のQCのための外部検証プロトコルである。
データセット:https://huggingface.co/datasets/lanqz7766/OpenBrain
コード:https://github.com/lanqz7766/openbrain
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