論文の概要: Prediction of Drug Synergy by Ensemble Learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2001.01997v1
- Date: Tue, 7 Jan 2020 12:21:37 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-01-13 20:36:59.063892
- Title: Prediction of Drug Synergy by Ensemble Learning
- Title(参考訳): アンサンブル学習による薬物シナジーの予測
- Authors: I\c{s}{\i}ksu Ek\c{s}io\u{g}lu, Mehmet Tan
- Abstract要約: 薬物相乗効果の予測における異なる化合物表現の有効性について検討した。
大規模な薬物併用画面データセットにおいて、この問題に未使用の有望な表現の使用を最初に示す。
次に、各ベースラインモデルより優れた表現モデルの組み合わせについてアンサンブルを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: One of the promising methods for the treatment of complex diseases such as
cancer is combinational therapy. Due to the combinatorial complexity, machine
learning models can be useful in this field, where significant improvements
have recently been achieved in determination of synergistic combinations. In
this study, we investigate the effectiveness of different compound
representations in predicting the drug synergy. On a large drug combination
screen dataset, we first demonstrate the use of a promising representation that
has not been used for this problem before, then we propose an ensemble on
representation-model combinations that outperform each of the baseline models.
- Abstract(参考訳): 癌などの複雑な疾患を治療するための有望な方法の1つは、組み合わせ療法である。
組合せ複雑性のため、機械学習モデルはこの分野で有用であり、近年、相乗的組み合わせの決定において重要な改善がなされている。
本研究では,薬物相乗効果の予測における異なる化合物表現の有効性について検討した。
大規模ドラッグコンバインドスクリーンデータセットにおいて,我々はまず,この問題に使用されていない有望な表現の使用を実演し,その後,各ベースラインモデルに匹敵する表現モデルとモデルの組み合わせに関するアンサンブルを提案する。
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