論文の概要: Biological Random Walks: integrating heterogeneous data in disease gene
prioritization
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2002.07064v1
- Date: Fri, 14 Feb 2020 17:46:35 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-01-01 04:31:40.414262
- Title: Biological Random Walks: integrating heterogeneous data in disease gene
prioritization
- Title(参考訳): 生物学的ランダムウォーク:病気遺伝子の優先順位付けにおける異種データの統合
- Authors: Michele Gentili, Leonardo Martini, Manuela Petti, Lorenzo Farina and
Luca Becchetti
- Abstract要約: 本研究は,ネットワーク伝搬に基づく遺伝子優先順位付けアルゴリズムにおいて,生物学的情報を活用する統一的な枠組みを提案する。
乳がんデータに対する予備的結果は,最先端のベースラインに対して有意な改善を示した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.4489463428855132
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: This work proposes a unified framework to leverage biological information in
network propagation-based gene prioritization algorithms. Preliminary results
on breast cancer data show significant improvements over state-of-the-art
baselines, such as the prioritization of genes that are not identified as
potential candidates by interactome-based algorithms, but that appear to be
involved in/or potentially related to breast cancer, according to a functional
analysis based on recent literature.
- Abstract(参考訳): 本研究は,ネットワーク伝搬に基づく遺伝子優先化アルゴリズムにおいて生物情報を活用するための統一フレームワークを提案する。
乳がんデータに対する予備的な結果は、intertoomeベースのアルゴリズムによって潜在的な候補として同定されないが、乳がんにかかわるあるいは関連する可能性のある遺伝子の優先順位付けなど、最先端のベースラインよりも大幅に改善している。
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