論文の概要: Uncertainty-Gated Stochastic Sequential Model for EHR Mortality
Prediction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2003.00655v1
- Date: Mon, 2 Mar 2020 04:41:28 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-27 04:22:19.467403
- Title: Uncertainty-Gated Stochastic Sequential Model for EHR Mortality
Prediction
- Title(参考訳): EHR死亡予測のための不確かさグラフ付き確率列モデル
- Authors: Eunji Jun, Ahmad Wisnu Mulyadi, Jaehun Choi, Heung-Il Suk
- Abstract要約: 本稿では,欠落変数の分布を推定し,隠れ状態の更新を行い,院内死亡の可能性を予測できる新しい変動再帰ネットワークを提案する。
我々のモデルは、これらの手順を1つのストリームで実行し、エンドツーエンドで全てのネットワークパラメータを共同で学習できることは注目に値する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.170898159041278
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Electronic health records (EHR) are characterized as non-stationary,
heterogeneous, noisy, and sparse data; therefore, it is challenging to learn
the regularities or patterns inherent within them. In particular, sparseness
caused mostly by many missing values has attracted the attention of
researchers, who have attempted to find a better use of all available samples
for determining the solution of a primary target task through the defining a
secondary imputation problem. Methodologically, existing methods, either
deterministic or stochastic, have applied different assumptions to impute
missing values. However, once the missing values are imputed, most existing
methods do not consider the fidelity or confidence of the imputed values in the
modeling of downstream tasks. Undoubtedly, an erroneous or improper imputation
of missing variables can cause difficulties in modeling as well as a degraded
performance. In this study, we present a novel variational recurrent network
that (i) estimates the distribution of missing variables allowing to represent
uncertainty in the imputed values, (ii) updates hidden states by explicitly
applying fidelity based on a variance of the imputed values during a recurrence
(i.e., uncertainty propagation over time), and (iii) predicts the possibility
of in-hospital mortality. It is noteworthy that our model can conduct these
procedures in a single stream and learn all network parameters jointly in an
end-to-end manner. We validated the effectiveness of our method using the
public datasets of MIMIC-III and PhysioNet challenge 2012 by comparing with and
outperforming other state-of-the-art methods for mortality prediction
considered in our experiments. In addition, we identified the behavior of the
model that well represented the uncertainties for the imputed estimates, which
indicated a high correlation between the calculated MAE and the uncertainty.
- Abstract(参考訳): 電子健康記録(EHR)は、非定常、異質、ノイズ、スパースデータとして特徴付けられるため、その内部に存在する規則性やパターンを学ぶことは困難である。
特に、主に多くの不足値によって引き起こされるスパース性は、二次計算問題の定義を通じて、主目的タスクの解を決定するために利用可能なすべてのサンプルをよりよく利用しようと試みた研究者の注目を集めている。
方法論的には、決定的あるいは確率的な既存の手法は、欠落した値を暗示するために異なる仮定を適用している。
しかし、一度不足した値がインプットされると、既存のほとんどのメソッドは下流タスクのモデリングにおいて、インプットされた値の忠実さや信頼性を考慮しない。
必然的に、不適切な変数の誤ったあるいは不適切な命令は、モデリングの困難や劣化した性能を引き起こす可能性がある。
本研究では,新しい変動リカレントネットワークを提案する。
(i)不確実性を表すための欠落変数の分布を推定する。
二 繰り返し(時間の経過に伴う不確かさの伝播)におけるインプット値のばらつきに基づいて明示的に忠実さを適用して隠蔽状態を更新すること。
(iii) 病院内死亡の可能性を予測する。
モデルがこれらの手順を単一のストリームで実行し、すべてのネットワークパラメータをエンドツーエンドで共同で学習できることは注目に値する。
実験で検討した死亡率予測のための他の最先端手法との比較と性能評価を行い,mime-iiiとphysionet challenge 2012の公開データセットを用いて本手法の有効性を検証した。
また,推定された推定値の不確かさをよく表わしたモデルの挙動を同定し,計算されたmaeと不確実性との間に高い相関関係を示した。
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