論文の概要: Gastric histopathology image segmentation using a hierarchical
conditional random field
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2003.01302v5
- Date: Mon, 19 Oct 2020 14:03:28 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-26 22:17:58.446193
- Title: Gastric histopathology image segmentation using a hierarchical
conditional random field
- Title(参考訳): 階層的条件付ランダムフィールドを用いた胃病理像分割
- Authors: Changhao Sun, Chen Li, Jinghua Zhang, Muhammad Rahaman, Shiliang Ai,
Hao Chen, Frank Kulwa, Yixin Li, Xiaoyan Li, Tao Jiang
- Abstract要約: 新たな条件付ランダムフィールド(HCRF)に基づく胃組織像(GHIS)法を提案する。
HCRFモデルは高いセグメンテーション性能を示し、GHIS分野におけるその有効性と将来の可能性を示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 16.920864110707747
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: For the Convolutional Neural Networks (CNNs) applied in the intelligent
diagnosis of gastric cancer, existing methods mostly focus on individual
characteristics or network frameworks without a policy to depict the integral
information. Mainly, Conditional Random Field (CRF), an efficient and stable
algorithm for analyzing images containing complicated contents, can
characterize spatial relation in images. In this paper, a novel Hierarchical
Conditional Random Field (HCRF) based Gastric Histopathology Image Segmentation
(GHIS) method is proposed, which can automatically localize abnormal (cancer)
regions in gastric histopathology images obtained by an optical microscope to
assist histopathologists in medical work. This HCRF model is built up with
higher order potentials, including pixel-level and patch-level potentials, and
graph-based post-processing is applied to further improve its segmentation
performance. Especially, a CNN is trained to build up the pixel-level
potentials and another three CNNs are fine-tuned to build up the patch-level
potentials for sufficient spatial segmentation information. In the experiment,
a hematoxylin and eosin (H&E) stained gastric histopathological dataset with
560 abnormal images are divided into training, validation and test sets with a
ratio of 1 : 1 : 2. Finally, segmentation accuracy, recall and specificity of
78.91%, 65.59%, and 81.33% are achieved on the test set. Our HCRF model
demonstrates high segmentation performance and shows its effectiveness and
future potential in the GHIS field.
- Abstract(参考訳): 胃癌のインテリジェント診断に応用された畳み込みニューラルネットワーク(CNN)では、既存の手法は主に、統合情報を記述するポリシーのない個々の特徴やネットワークフレームワークに焦点を当てている。
主に、複雑な内容を含む画像を分析する効率的で安定したアルゴリズムである条件ランダムフィールド(CRF)は、画像内の空間関係を特徴付けることができる。
本稿では, 光学顕微鏡により得られた胃病理像の異常領域(癌領域)を自動的に局在化し, 病理組織学を補助する新しい階層的条件付きランダムフィールド (hcrf) ベースの胃病理画像分割法 (ghis) を提案する。
このHCRFモデルは、ピクセルレベルやパッチレベルのポテンシャルを含む高次ポテンシャルで構築され、グラフベースの後処理を適用してセグメンテーション性能をさらに向上する。
特に、CNNはピクセルレベルのポテンシャルを構築するために訓練され、さらに3つのCNNは、十分な空間分割情報のためにパッチレベルのポテンシャルを構築するために微調整される。
実験では,560個の異常画像を有するヘマトキシリンとエオシン(H&E)染色胃組織学的データセットを,1 : 1 : 2の比率でトレーニング,検証,テストセットに分割した。
最後に、テストセットでセグメンテーション精度、リコール、特異度78.91%、65.59%、81.33%を達成する。
HCRFモデルは高いセグメンテーション性能を示し、GHIS分野での有効性と将来の可能性を示す。
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