論文の概要: Coronary Artery Segmentation from Intravascular Optical Coherence
Tomography Using Deep Capsules
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2003.06080v4
- Date: Thu, 8 Apr 2021 03:02:59 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-24 01:23:08.660960
- Title: Coronary Artery Segmentation from Intravascular Optical Coherence
Tomography Using Deep Capsules
- Title(参考訳): 深部カプセルを用いた血管内光コヒーレンス・トモグラフィからの冠動脈解離
- Authors: Arjun Balaji, Lachlan Kelsey, Kamran Majeed, Carl Schultz, Barry Doyle
- Abstract要約: 血管内光コヒーレンストモグラフィーによる冠動脈の分画と解析は,冠動脈疾患の診断と管理の重要な側面である。
現在の画像処理手法は、専門家ラベル付きデータセットを生成するのに必要な時間と、分析中のバイアスの可能性によって妨げられている。
セグメンテーションの品質を犠牲にすることなく、推論時に高速なメモリフットプリントのモデルを開発する。
私たちは、私たちの開発が12%のパラメータを使用しながら、セグメンテーション品質とロバストネスの観点から最先端の機械学習手法と同等のモデルであるDeepCapにつながっていることを示しています。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: The segmentation and analysis of coronary arteries from intravascular optical
coherence tomography (IVOCT) is an important aspect of diagnosing and managing
coronary artery disease. Current image processing methods are hindered by the
time needed to generate expert-labelled datasets and the potential for bias
during the analysis. Therefore, automated, robust, unbiased and timely geometry
extraction from IVOCT, using image processing, would be beneficial to
clinicians. With clinical application in mind, we aim to develop a model with a
small memory footprint that is fast at inference time without sacrificing
segmentation quality. Using a large IVOCT dataset of 12,011 expert-labelled
images from 22 patients, we construct a new deep learning method based on
capsules which automatically produces lumen segmentations. Our dataset contains
images with both blood and light artefacts (22.8%), as well as metallic (23.1%)
and bioresorbable stents (2.5%). We split the dataset into a training (70%),
validation (20%) and test (10%) set and rigorously investigate design
variations with respect to upsampling regimes and input selection. We show that
our developments lead to a model, DeepCap, that is on par with state-of-the-art
machine learning methods in terms of segmentation quality and robustness, while
using as little as 12% of the parameters. This enables DeepCap to have per
image inference times up to 70% faster on GPU and up to 95% faster on CPU
compared to other state-of-the-art models. DeepCap is a robust automated
segmentation tool that can aid clinicians to extract unbiased geometrical data
from IVOCT.
- Abstract(参考訳): 血管内光コヒーレンストモグラフィ(IVOCT)による冠状動脈の分画と解析は,冠動脈疾患の診断と管理の重要な側面である。
現在の画像処理手法は、専門家ラベル付きデータセットの生成に必要な時間と分析中のバイアスの可能性によって妨げられている。
したがって、画像処理を用いたivoctからの自動化、ロバスト、非バイアス、タイムリーな幾何抽出は臨床医にとって有益である。
臨床応用を念頭に置いて,セグメンテーション品質を犠牲にすることなく,推定時間を短縮したメモリフットプリントの少ないモデルの開発を目標としている。
22名の患者から得られた12,011個のエキスパートラベル画像からなる大規模ivoctデータセットを用いて,ルーメンセグメンテーションを自動的に生成するカプセルに基づく新しい深層学習法を構築した。
我々のデータセットには、血液と光の人工物(22.8%)と金属(23.1%)と生体吸収性ステント(2.5%)の画像が含まれている。
データセットをトレーニング(70%)、バリデーション(20%)、テスト(10%)に分割し、システムのスケールアップと入力選択に関して設計のバリエーションを厳格に調査しました。
私たちは、私たちの開発が12%のパラメータを使用しながら、セグメンテーションの品質と堅牢性の観点から最先端の機械学習手法と同等のモデルであるDeepCapに繋がることを示す。
これにより、DeepCapは他の最先端モデルと比較してGPUでは最大70%高速、CPUでは最大95%高速となる。
deepcapはロバストな自動セグメンテーションツールで、臨床医がivoctから偏りのない幾何学的データを抽出できるようにする。
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