論文の概要: Spatio-Temporal Graph Convolution for Resting-State fMRI Analysis
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2003.10613v3
- Date: Tue, 29 Jun 2021 03:47:30 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-20 08:12:47.949792
- Title: Spatio-Temporal Graph Convolution for Resting-State fMRI Analysis
- Title(参考訳): 静止状態fMRI解析のための時空間グラフ畳み込み法
- Authors: Soham Gadgil, Qingyu Zhao, Adolf Pfefferbaum, Edith V. Sullivan, Ehsan
Adeli, Kilian M. Pohl
- Abstract要約: BOLD時系列の短いサブシーケンスに基づいて、時空間グラフ畳み込みネットワーク(ST-GCN)を訓練し、機能接続の非定常特性をモデル化する。
St-GCNはBOLD信号に基づいて性別や年齢を予測する一般的な手法よりもはるかに正確である。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 11.85489505372321
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: The Blood-Oxygen-Level-Dependent (BOLD) signal of resting-state fMRI
(rs-fMRI) records the temporal dynamics of intrinsic functional networks in the
brain. However, existing deep learning methods applied to rs-fMRI either
neglect the functional dependency between different brain regions in a network
or discard the information in the temporal dynamics of brain activity. To
overcome those shortcomings, we propose to formulate functional connectivity
networks within the context of spatio-temporal graphs. We train a
spatio-temporal graph convolutional network (ST-GCN) on short sub-sequences of
the BOLD time series to model the non-stationary nature of functional
connectivity. Simultaneously, the model learns the importance of graph edges
within ST-GCN to gain insight into the functional connectivities contributing
to the prediction. In analyzing the rs-fMRI of the Human Connectome Project
(HCP, N=1,091) and the National Consortium on Alcohol and Neurodevelopment in
Adolescence (NCANDA, N=773), ST-GCN is significantly more accurate than common
approaches in predicting gender and age based on BOLD signals. Furthermore, the
brain regions and functional connections significantly contributing to the
predictions of our model are important markers according to the neuroscience
literature.
- Abstract(参考訳): 静止状態fMRI(rs-fMRI)のBOLD信号は、脳内の内因性機能ネットワークの時間的ダイナミクスを記録している。
しかし、r-fMRIに適用された既存のディープラーニング手法は、ネットワーク内の異なる脳領域間の機能的依存を無視したり、脳活動の時間的ダイナミクスで情報を破棄する。
これらの欠点を克服するために,時空間グラフの文脈で機能的接続ネットワークを定式化する。
我々はBOLD時系列の短いサブシーケンスに基づいて時空間グラフ畳み込みネットワーク(ST-GCN)を訓練し、機能接続の非定常特性をモデル化する。
同時に、モデルがst-gcn内のグラフエッジの重要性を学習し、予測に寄与する機能的コネクティビティに関する洞察を得る。
HCP(Human Connectome Project)とNational Consortium on Alcohol and Neurodevelopment in Adolescence(NCANDA, N=773)のrs-fMRIの分析において、ST-GCNはBOLD信号に基づいて性別や年齢を予測する一般的な手法よりもはるかに正確である。
さらに,脳領域と機能的結合がモデル予測に大きく寄与することは,神経科学文献に拠れば重要な指標である。
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