論文の概要: Learning Dynamic Graph Representation of Brain Connectome with
Spatio-Temporal Attention
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2105.13495v1
- Date: Thu, 27 May 2021 23:06:50 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-05-31 13:44:34.235289
- Title: Learning Dynamic Graph Representation of Brain Connectome with
Spatio-Temporal Attention
- Title(参考訳): 時空間的注意を伴う脳コネクトームの動的グラフ表現の学習
- Authors: Byung-Hoon Kim, Jong Chul Ye, Jae-Jin Kim
- Abstract要約: 本稿では,脳コネクトームの動的グラフ表現を時間的注意とともに学習するSTAGINを提案する。
HCP-RestとHCP-Taskデータセットの実験は,提案手法の優れた性能を示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 33.049423523704824
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Functional connectivity (FC) between regions of the brain can be assessed by
the degree of temporal correlation measured with functional neuroimaging
modalities. Based on the fact that these connectivities build a network,
graph-based approaches for analyzing the brain connectome have provided
insights into the functions of the human brain. The development of graph neural
networks (GNNs) capable of learning representation from graph structured data
has led to increased interest in learning the graph representation of the brain
connectome. Although recent attempts to apply GNN to the FC network have shown
promising results, there is still a common limitation that they usually do not
incorporate the dynamic characteristics of the FC network which fluctuates over
time. In addition, a few studies that have attempted to use dynamic FC as an
input for the GNN reported a reduction in performance compared to static FC
methods, and did not provide temporal explainability. Here, we propose STAGIN,
a method for learning dynamic graph representation of the brain connectome with
spatio-temporal attention. Specifically, a temporal sequence of brain graphs is
input to the STAGIN to obtain the dynamic graph representation, while novel
READOUT functions and the Transformer encoder provide spatial and temporal
explainability with attention, respectively. Experiments on the HCP-Rest and
the HCP-Task datasets demonstrate exceptional performance of our proposed
method. Analysis of the spatio-temporal attention also provide concurrent
interpretation with the neuroscientific knowledge, which further validates our
method. Code is available at https://github.com/egyptdj/stagin
- Abstract(参考訳): 脳の領域間の機能的接続(FC)は、機能的ニューロイメージングによる時間的相関度によって評価することができる。
これらのコネクティビティがネットワークを構築するという事実に基づいて、脳コネクティビティを解析するためのグラフベースのアプローチは、人間の脳の機能に関する洞察を提供する。
グラフ構造化データから表現を学習できるグラフニューラルネットワーク(GNN)の開発により、脳コネクトームのグラフ表現の学習への関心が高まっている。
FCネットワークにGNNを適用しようとする最近の試みは有望な結果を示しているが、通常は時間とともに変動するFCネットワークの動的特性を取り入れないという一般的な制限がある。
さらに、GNNの入力として動的FCを使用しようとするいくつかの研究は、静的FC法と比較して性能の低下を報告し、時間的説明性を提供しなかった。
本稿では,脳コネクトームの動的グラフ表現を時空間的注意で学習する方法であるstaginを提案する。
具体的には、脳グラフの時系列シーケンスをスタギンに入力して動的グラフ表現を得る一方、新しい読み出し機能とトランスフォーマエンコーダは、それぞれ注意して空間的及び時間的説明性を提供する。
HCP-RestとHCP-Taskデータセットの実験は,提案手法の優れた性能を示す。
時空間的注意の解析は神経科学知識の同時解釈にも役立ち,本手法をさらに検証する。
コードはhttps://github.com/egyptdj/staginで入手できる。
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