論文の概要: When Weak Becomes Strong: Robust Quantification of White Matter
Hyperintensities in Brain MRI scans
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2004.05578v1
- Date: Sun, 12 Apr 2020 10:14:14 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-14 05:30:18.744385
- Title: When Weak Becomes Strong: Robust Quantification of White Matter
Hyperintensities in Brain MRI scans
- Title(参考訳): 弱体化が強まるとき--脳mriにおける白質高濃度のロバスト定量化
- Authors: Oliver Werner, Kimberlin M.H. van Wijnen, Wiro J. Niessen, Marius de
Groot, Meike W. Vernooij, Florian Dubost, Marleen de Bruijne
- Abstract要約: 我々は、脳MRIでホワイトマターハイパーインテンシティ(WMH)の容積を予測するためにニューラルネットワークを訓練した。
WMHボリュームを反映する弱いラベルを用いて最適化されたネットワークは、ボクセルワイドセグメンテーションに最適化されたネットワークよりもWMHボリューム予測に優れていた。
以上の結果から, バイオマーカーから抽出可能なバイオマーカーを画像化するために, バイオマーカーを直接予測するためのトレーニングネットワークは, 中間セグメンテーションステップを解くよりも, より堅牢な結果をもたらす可能性が示唆された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 7.189330860389267
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: To measure the volume of specific image structures, a typical approach is to
first segment those structures using a neural network trained on voxel-wise
(strong) labels and subsequently compute the volume from the segmentation. A
more straightforward approach would be to predict the volume directly using a
neural network based regression approach, trained on image-level (weak) labels
indicating volume.
In this article, we compared networks optimized with weak and strong labels,
and study their ability to generalize to other datasets. We experimented with
white matter hyperintensity (WMH) volume prediction in brain MRI scans. Neural
networks were trained on a large local dataset and their performance was
evaluated on four independent public datasets. We showed that networks
optimized using only weak labels reflecting WMH volume generalized better for
WMH volume prediction than networks optimized with voxel-wise segmentations of
WMH. The attention maps of networks trained with weak labels did not seem to
delineate WMHs, but highlighted instead areas with smooth contours around or
near WMHs. By correcting for possible confounders we showed that networks
trained on weak labels may have learnt other meaningful features that are more
suited to generalization to unseen data. Our results suggest that for imaging
biomarkers that can be derived from segmentations, training networks to predict
the biomarker directly may provide more robust results than solving an
intermediate segmentation step.
- Abstract(参考訳): 特定の画像構造の体積を測定するためには、まず、voxel-wise (strong)ラベルでトレーニングされたニューラルネットワークを使用してそれらの構造を分割し、その後、セグメンテーションからボリュームを計算する。
より単純なアプローチは、ボリュームを示すイメージレベル(弱)ラベルに基づいてトレーニングされたニューラルネットワークベースの回帰アプローチを使って、ボリュームを直接予測することです。
本稿では,弱いラベルと強いラベルを最適化したネットワークを比較し,他のデータセットに一般化する能力について検討する。
脳MRIにおける白質超強度(WMH)容積予測実験を行った。
ニューラルネットワークは大規模なローカルデータセットでトレーニングされ、そのパフォーマンスは4つの独立したパブリックデータセットで評価された。
WMHボリュームを反映する弱いラベルのみを用いて最適化されたネットワークは、WMHのボクセルワイドセグメンテーションに最適化されたネットワークよりもWMHボリューム予測に優れていた。
弱いラベルで訓練されたネットワークのアテンションマップは、wmhsを示すものではなく、wmhs周辺の滑らかな輪郭のある領域を強調した。
共同設立者の可能性を正すことで、弱いラベルで訓練されたネットワークは、知覚できないデータを一般化するのにより適した他の有意義な特徴を学ぶことができることを示した。
その結果, セグメンテーションから得られるバイオマーカーを画像化する場合, 中間セグメンテーションステップを解くよりも, 直接的にバイオマーカーを予測するためのトレーニングネットワークがより堅牢な結果をもたらす可能性が示唆された。
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