論文の概要: Organ at Risk Segmentation for Head and Neck Cancer using Stratified
Learning and Neural Architecture Search
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2004.08426v1
- Date: Fri, 17 Apr 2020 19:15:48 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-12 13:35:46.488395
- Title: Organ at Risk Segmentation for Head and Neck Cancer using Stratified
Learning and Neural Architecture Search
- Title(参考訳): 階層的学習とニューラルアーキテクチャー検索を用いた頭頸部癌のリスクセグメンテーション
- Authors: Dazhou Guo, Dakai Jin, Zhuotun Zhu, Tsung-Ying Ho, Adam P. Harrison,
Chun-Hung Chao, Jing Xiao, Alan Yuille, Chien-Yu Lin, Le Lu
- Abstract要約: リスクセグメンテーション(SOARS)は、OARをアンカーレベル、中間レベル、小規模、ハードカテゴリに分類するアプローチである。
特に、アンカーOARは中級とS&Hカテゴリーのガイドに使用される。
我々は2D、3DまたはPseudo-3Dカテゴリを選択するために、微分可能なニューラルネットワークサーチ(NAS)を用いる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 21.95171310651385
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: OAR segmentation is a critical step in radiotherapy of head and neck (H&N)
cancer, where inconsistencies across radiation oncologists and prohibitive
labor costs motivate automated approaches. However, leading methods using
standard fully convolutional network workflows that are challenged when the
number of OARs becomes large, e.g. > 40. For such scenarios, insights can be
gained from the stratification approaches seen in manual clinical OAR
delineation. This is the goal of our work, where we introduce stratified organ
at risk segmentation (SOARS), an approach that stratifies OARs into anchor,
mid-level, and small & hard (S&H) categories. SOARS stratifies across two
dimensions. The first dimension is that distinct processing pipelines are used
for each OAR category. In particular, inspired by clinical practices, anchor
OARs are used to guide the mid-level and S&H categories. The second dimension
is that distinct network architectures are used to manage the significant
contrast, size, and anatomy variations between different OARs. We use
differentiable neural architecture search (NAS), allowing the network to choose
among 2D, 3D or Pseudo-3D convolutions. Extensive 4-fold cross-validation on
142 H&N cancer patients with 42 manually labeled OARs, the most comprehensive
OAR dataset to date, demonstrates that both pipeline- and NAS-stratification
significantly improves quantitative performance over the state-of-the-art (from
69.52% to 73.68% in absolute Dice scores). Thus, SOARS provides a powerful and
principled means to manage the highly complex segmentation space of OARs.
- Abstract(参考訳): OARセグメンテーション(OAR segmentation)は頭頸部癌(H&N)の放射線治療において重要なステップである。
しかし、標準の完全畳み込みネットワークワークフローを使用するリードメソッドは、例えば 40 以上の oar 数が大きくなると問題となる。
このようなシナリオでは、手動臨床のOAR記述に見られる階層化アプローチから洞察を得ることができる。
これは、リスクセグメンテーション(SOARS)において、OARをアンカー、ミドルレベル、およびスモール&ハード(S&H)カテゴリに階層化するアプローチを導入するという、私たちの仕事の目標です。
SOARSは2つの次元にまたがる。
第1の次元は、OARカテゴリ毎に異なる処理パイプラインが使用されることです。
特に、臨床実践にインスパイアされたアンカーOARは、中級およびS&Hカテゴリーのガイドに使用される。
第2の次元は、異なるネットワークアーキテクチャを使用して、異なるOAR間の大きなコントラスト、サイズ、解剖学的バリエーションを管理することである。
微分可能なニューラルネットワーク検索(nas)を使用して,ネットワークが2d,3d,あるいは疑似3dの畳み込みを選択できるようにする。
これまでに最も包括的なoarデータセットである42の手動ラベル付きoarを持つ142のh&n癌患者に対する4倍のクロスバリデーションは、パイプライン層とnas層の両方が最先端(絶対値の69.52%から73.68%)の定量的パフォーマンスを大幅に改善していることを示している。
したがって、SOARSはOARの非常に複雑なセグメンテーション空間を管理するための強力で原則化された手段を提供します。
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