論文の概要: Knowledge Base Completion for Constructing Problem-Oriented Medical
Records
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2004.12905v2
- Date: Fri, 7 Aug 2020 13:22:31 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-09 04:09:17.917624
- Title: Knowledge Base Completion for Constructing Problem-Oriented Medical
Records
- Title(参考訳): 問題指向医療記録構築のための知識ベース補完
- Authors: James Mullenbach, Jordan Swartz, T. Greg McKelvey, Hui Dai, David
Sontag
- Abstract要約: 電子健康記録に機械学習を用いて、関連する薬品、手順、ラボテストの問題をベースとしたグループ化を自動的に構築する方法を示す。
我々は,本アルゴリズムが関連する薬剤,手順,検査を提案できる能力を評価し,本手法がトレーニング中に隠された問題に対しても有効な提案を提供することを確認した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.789980015306525
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Both electronic health records and personal health records are typically
organized by data type, with medical problems, medications, procedures, and
laboratory results chronologically sorted in separate areas of the chart. As a
result, it can be difficult to find all of the relevant information for
answering a clinical question about a given medical problem. A promising
alternative is to instead organize by problems, with related medications,
procedures, and other pertinent information all grouped together. A recent
effort by Buchanan (2017) manually defined, through expert consensus, 11
medical problems and the relevant labs and medications for each. We show how to
use machine learning on electronic health records to instead automatically
construct these problem-based groupings of relevant medications, procedures,
and laboratory tests. We formulate the learning task as one of knowledge base
completion, and annotate a dataset that expands the set of problems from 11 to
32. We develop a model architecture that exploits both pre-trained concept
embeddings and usage data relating the concepts contained in a longitudinal
dataset from a large health system. We evaluate our algorithms' ability to
suggest relevant medications, procedures, and lab tests, and find that the
approach provides feasible suggestions even for problems that are hidden during
training. The dataset, along with code to reproduce our results, is available
at https://github.com/asappresearch/kbc-pomr.
- Abstract(参考訳): 電子健康記録と個人の健康記録は、典型的にはデータ型によって整理され、医学的問題、薬品、処置、検査結果がチャートの別々の領域で時系列的に並べられる。
その結果、ある医療問題に関する臨床質問に回答するためのすべての関連情報を見つけることが困難になる可能性がある。
有望な代替手段は、問題によって組織化することであり、関連する薬、手順、その他の関連する情報がすべてまとめられている。
ブキャナン(2017年)による最近の取り組みは、専門家のコンセンサス、11の医療問題、関連する研究室と医薬品を手作業で定義した。
そこで本研究では,電子健康記録に機械学習を応用し,その代わりに関連する医薬品,プロシージャ,検査などの問題に基づくグループ化を自動的に構築する方法を示す。
学習課題を知識ベース完了の1つとして定式化し,問題の集合を11から32に拡張するデータセットを注釈化する。
本研究では,事前学習された概念埋め込みと,大規模健康システムからの縦型データセットに含まれる概念に関連する利用データの両方を利用するモデルアーキテクチャを開発する。
我々は,本アルゴリズムが関連する薬剤,手順,検査を提案できる能力を評価し,本手法がトレーニング中に隠された問題に対しても有効な提案を提供することを確認した。
結果の再現コードとともにデータセットは、https://github.com/asappresearch/kbc-pomrで利用可能です。
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